Джонатан Лосос - Удивительная эволюция. Биологическая история Земли в невероятных превращениях и мутациях организмов

74219 Работая с ведущими экспертами в области изучения генома: П. Колосимо и др. «Широко распространенная параллельная эволюция у колюшки, осуществленная путем повторяющейся фиксации аллелей Ectodysplasin». Science 307: 1928–1933. 2005.

75219 процесс отбора длины брюшных игл: Д. Реннисон. «Установление движущих факторов дивергенции: определение и оценка естественного отбора у трехиглой колюшки». Докторская диссертация. Университет Британской Колумбии. 2006.

76220 Небраска Сэндхиллс: Мое описание проекта с мышами в Сэндхиллс основано на пространных беседах с Роуаном Барреттом.

77222 Хищные птицы: Л. Дайс. «Эффективность осуществляемого совами естественного отбора мышей, которые не сливаются с окружающей средой». «Доклады лаборатории биологии позвоночных животных» 34. 1947. – С. 1–20.

78222 заключение было сделано на основе полученных генетических различий: К. Линнен и др. Об источнике и распространении адаптивной аллели у мышей. Science 325: 1095–1098. 2009.

Глава девятая: ПОВТОРНОЕ ПРОКРУЧИВАНИЕ ПЛЕНКИ

79248 24 февраля 1988 г.: Эксперименты Ленски хорошо задокументированы, и по ним легко найти материалы и статьи как онлайн, так и в печатных журналах. Например, статья Т. Аппензеллера «Эволюция в пробирке ловит время». Science 284: 2108. 1990; И. Пеннесси. «Человек, который запер эволюцию в пробирке». Science 342: 790–793.2013. Ленски сам подытожил результаты своей работы в блоге Telliamed Revisited (29 декабря 2013 г. https://telliamedrevisited.wordpress.com/2013/12/29/whatweve-learned- about- evolutionfrom-the- Itee- number-5/6)/ Я узнал много подробностей этой исследовательской программы и личных историй большинства ее участников, посетив лабораторию Ленски 2–3 октября 2014 г., а также благодаря обширной переписке с Заком Блаунтом и общению с Ричем Ленски, Тимом Купером и Крисом Борландом.

80251 Труды Национальной академии наук: Ленски Р., Травизано М. Динамика адаптации и расхождения: эксперимент с генерацией в 10 000 особей среди популяций бактерий. «Труды Национальной академии наук США» 91: 6808–6814.1994.

81252 между популяциями оставались различия: Ленски Р. Фенотипическая и геномная эволюция в ходе эксперимента с генерацией в 20 000 особей бактерии Escherichia coli. 2004.

82253 эволюция была очень повторяема: Ленски Р. Эволюция в действии: генерация в 50 000 особей передает привет Чарльзу Дарвину. «Микроб» 6.2011. – С. 30–33.

83253 Как и Ленски, Пола Рейни: переписка с Полом Рейни раскрыла подробности его биографии и исследования Pseudomonas fl uorescens.

84257 Травизано и Рейни завершили работу: Рейни П., Травизано М. Адаптивная радиация в неоднородной среде. Nature 394.1998. – С. 69–72.

85263 Однако у снежинок: У. Рэтклифф и др. Экспериментальная эволюция многоклеточности. «Труды Национальной академии наук США» 109: 1595–1600.2012.

86264 В ходе другого исследования E.coli: О. Тенейлон и др. Молекулярные различия адаптивной конвергенции. Science 335.2012. – С. 457–461.

Глава десятая: ПРОРЫВ В БУТЫЛКЕ

87269 названы в честь тех мест из мифов и легенд: Зак Блаунт, личные беседы.

88270 самый тшательно изучаемый вид на земле: Циммер К. Рождение нового, изменение старого. The Loom 19 сентября 2012 http://blogs.discovermagazine.com/loom/2012/09/19/the- birthof-the- new- the- rewiring- of- theold/#WCO6JeErJjs.

89272 Плохая новость в том: Гулд Д. Удивительная жизнь. С. 48.

90273 «серьезного и умного»: Рич Ленски, личное общение.

91275 стали очевидными два результата: Блаунт З., Борланд К., Ленски Р. Историческая контингентность и эволюция ключевого эволюционного новообразования в экспериментальной популяции Escherichia coli. «Труды Национальной академии наук США» 105: 7899–7906.2008.

92276 Применив свою молекулярную магию: З. Блаунт и др. Геномный анализ ключевого эволюционного новообразования в экспериментальной популяции Escherichia coli. Nature 489.2012. – С. 513–518.

93278 здесь имеет место и вторая мутация: И. Квандт и др. Корректировка переменчивости синтеза цитрата усиливает и оптимизирует метаболическое эволюционное новообразование в эволюционном эксперименте Ленски. 2015.

94279 Противостояние случайности и необходимости: Деннехи Д. Классическая цитата недели: флуктуационный тест. «Эволюционный биолог». 9 июля 2008 г.

95279 недавно проведенная работа в лаборатории Пола Рейни: Линд П., Фарр Э., Рейни П. Экспериментальная эволюция демонстрирует скрытое многообразие эволюционных путей. 2015.

96280 В другом исследовании E.coli: М. Фризен и др. Экспериментальное доказательство симпатрического экологического расхождения изза основанного на повторяемости соперничества у Escherichia coli. «Эволюция» 58.2014. – С. 245–260.

97281 в интервью: Д. Уилсон. «Мастер в области эволюционной биологии: интервью с Ричардом Ленски», «Этот взгляд на жизнь», 30 мая 2016 г. https://evolution- institute.org/article/evolutionary-biologys-mastercraft sman- an- interview- with- richardlenski/

Глава одиннадцатая: МЕЛЬЧАЙШИЕ ЧАСТИЦЫ И ПЬЯНЫЕ ПЛОДОВЫЕ МУШКИ

98282 Я называю этот эксперимент: Гулд. Удивительная жизнь. – С. 48.

99283 Эта великолепная десятиминутная сцена: источник тот же. – С. 287.

100283 любое прокручивание пленки: источник тот же. – С. 289.

101287 Исторические объяснения принимают форму: источник тот же.

102289 Измените любое предшествующее событие: источник тот же, – С. 51.

103289 Вернитесь в прошлое: Мейнард Смит Д. Воспользоваться эволюцией. «Нью- Йорк Ревью оф Букс», 14 мая 1992 г.

104291 Если быть точнее: Фред Коэн любезно поделился подробностями данного проекта в переписке по электронной почте.

105294 В среднем полет: Коэн Ф., Хоффман Э. Генетическая дивергенция при одинаковом отборе. «Генетика» 114.1986. – С. 145–163.

106295 Похожий эксперимент: Э. Спор и др. На фенотипические и генотипические конвергенции грибков влияет историческая контингентность и окружение. «Эволюция» 68:2014. – С. 772–790.

107297 Сообщив об этом результате: Р. Ленски и др. Долгосрочная экспериментальная эволюция у Escherichia coli. American Naturalist 138: 1315–1341.1991.

108298 Чтобы проверить эту идею: М. Травизано и др. Экспериментальные проверки роли адаптации, случайности и истории в эволюции. Science 267.1995. – С. 87–90.

109301 Гулд и вправду запутал всех своей метафорой: Битти Д. Прокручивая пленку жизни. Журнал «Философия» 103.2006. – С. 336–362.

110302 На удивление мало исследований: Удивительно, но пока никто еще не создал всеобъемлющего подробного описания всех этих исследований. Последними такими работами являются следующие: Оргогозо В. Прокручивая пленку жизни в двадцать первом веке. 2015. А также глава из книги, написанная Заком Блаунтом, где рассматриваются эксперименты с микробами и дается хорошая оценка долгосрочному эволюционному эксперименту. Блаунт З. Повороты истории в колбе: эксперименты с микробами в области эволюционной контингентности. 2016; Рамси Д., Пенс К. Случайность в эволюции. Чикаго «Чикаго юниверсити Пресс».

Глава двенадцатая: ЧЕЛОВЕЧЕСКАЯ СРЕДА

111305 подобный эксперимент был проведен: Вонг Э., Родриге Н., Кассен Р. Геномика адаптации в процессе экспериментальной эволюции условно- патогенного микроорганизма Pseudomonas aeruginosa. 2012.