Анатолий Клёсов - ДНК-генеалогия от А до Т

Вручную делать расчеты такой серии гаплотипов уже слишком трудозатратно, поскольку 470 гаплотипов в 111-маркерном формате содержат 52170 аллелей, то есть чисел в гаплотипах, и все эти аллели содержат 27187 мутаций. Как только подсчет мутаций завершен, дальше уже просто – делим 27187 на число гаплотипов и на константу скорости мутаций для 111-маркерных гаплотипов (0.198 мутаций на гаплотип на условное поколение в 25 лет), получаем 27187/470/0.198 = 292 → 392 условных поколения, то есть 9800 ± 980 лет до общего предка.

Но вручную так, конечно, никто не считает. Никто не считает не только потому, что долго, а потому что в мире есть всего два человека, которые умеют обрабатывать подобные серии гаплотипов, и знают, как это делать. Помимо автора настоящей книги, еще один – это И.Л. Рожанский, вместе с которым мы опубликовали серию статей по ДНК-генеалогии. Ну и, конечно, вручную считать такие серии данных смысла не имеет, для этого разработана специальная программа. Она и число мутаций подсчитывает, и остальные расчеты проводит. Для данной серии из 470 гаплотипов в 111-маркерном формате расчет проводится в течение одной секунды, и программа выводит на дисплей время до общего предка: 9801 ± 982 лет. Как видим, это то же самое время, которое получено при счете вручную, только без округления. Для тех же гаплотипов, но в 67-маркерном формате время до общего предка (без округления) получается 9241 ± 927 лет, то есть разница составляет всего 6 %, и оба числа совпадают в пределах указанной погрешности. Это вполне приемлемо для подобных расчетов. Это показывает, как на многих сотнях подобных примеров, что расчетный аппарат ДНК-генеалогии отлажен и надежно работает.

Пока найдена всего одна ископаемая гаплогруппа Е, субклада V13. Но даже она одна рассказала интересную историю о прошлом Европы. ДНК была выделена из костных остатков, найденных в древнем некрополе на северо-востоке Испании, с археологической датировкой 7000 лет назад. Из шести человек в захоронении пятеро оказались G2a (о них речь пойдет ниже), один – E1b-V13. [51] Lacan, М., Keyser, C., Ricaut, F.-X. et al. (2011) Ancient DNA suggests the leading role played by men in the Neolithic dissemination. Proc. Natl. Acad. Sei. US, 108,18255-18259.

Дерево 470 гаплотипов в 111-маркерном формате гаплогруппы/ субклада Е1b1b1-М35 (и нижестоящих субкладов вплоть до V92).

Построено по данным Проекта [52] https://www.familytreedna.com/public/E3b?iframe=yresults .

Так в 2011 году мы узнали, что носители субклада V13 жили в Европе еще 7 тысяч лет назад. Через три года была разработана методология расчетов времен образования субкладов по цепочке снипов, и было найдено, что субклад E-V13 образовался примерно 7700 лет назад [53] http://www.yfull.eom/tree/E/ . Но если расчитывать по мутациям в гаплотипах, то выясняется, что общий предок современных носителей E-V13 жил всего 3450 ± 350 лет назад [54] Discussions. The mutation rate constants in DNA genealogy and related issues. Вестник Российской Академии ДНК-генеалогии, том 4, № 11, 2108–2195 (2011). . На рисунке приведено соответствующее дерево гаплотипов, собранных по всей Европе и на прилегающих территориях. Видно, что они образуют симметричное ДНК-генеалогическое дерево, что указывает на их происхождение от одного общего предка. Все 193 гаплотипа в 67-маркерном формате содержат 2857 мутаций, поэтому их общий предок жил 2857/193/0.12 = 123 → 138 условных поколений назад, то есть те самые 3450 ± 350 лет назад.

Дерево 193 гаплотипов в 67-маркерном формате гаплогруппы/ субклада Е1b1b1-V13 (см. схему субкладов в тексте). Построено по данным Проектов [55] https://www.familytreedna.com/public/E3b?iframe=yresults , [56] https://www.familytreedna.com/public/E-V13/default. aspx?section=yresults . Общий предок показанной серии гаплотипов жил 3450 ± 350 лет назад.

Мы столь подробно на этом останавливаемся, чтобы показать разрыв во времени между датировкой ископаемого гаплотипа группы V-13, и датировкой общего предка современныхносителей той же группы. Разрыв составляет три с половиной тысячи лет. На самом деле, разрыв, скорее всего, начался примерно 4500 лет назад, и продолжался тысячу лет. Это было время выживания ДНК-генеалогической линии E1b-V13, пока выживание не состоялось окончательно.

Но почему именно 4500 лет назад? Откуда это известно? Известно потому, что гаплогруппа Е не единственная, которая пропала в Европе в те времена, и возродилась через одно-два тысячелетие, пройдя бутылочное горлышко популяции. Причем это возрождение часто оказывалось на других территориях, на периферии Европы или за ее пределами. Из Европы пропали гаплогруппы E-V13, G2a, I1, I2, R1a, и по времени это совпадает с двумя крупными историческими событиями – разрушением «Старой Европы», название которой было введено литовско-американской исследовательницей Марией Гимбутас пол века назад, и основывалось на большом комплексе археологических данных (в частности, сотнях сожженных поселений того времени), и заселением Европы эрбинами, носителями гаплогруппы R1b, которые создали так называемую археологическую культуру колоколовидных кубков (4800–3900 лет назад). Эрбины вышли с Пиренейского полуострова в континентальную Европу 4800–4600 лет назад, и заселили ее за последующие 700 лет. Это и привело к исчезновению из Европы практически всего мужского «коренного населения». А женщины «Старой Европы» не исчезли, более того, их численность вскоре пошла в рост, как показывают ископаемые мтДНК. С тех пор прошло более 4 тысяч лет, но и сейчас носители гаплогруппы R1b составляют почти две трети населения Центральной и Западной Европы. Остальные – либо потомки спасшихся на периферии Европы племен (на Балканах, в Скандинавии, на Британских островах), либо потомки более поздних мигрантов в Европу. Среди них были и носители субклада E-V13, потому общий предок современных носителей жил примерно 3500 лет назад, он и возродил род V13 в Европе. Все Y-хромосомные фигуральные нити современных E-V13 тянутся к нему.

Проведем интересный эксперимент на бумаге – проверим, как ископаемый гаплотип V13 соотносится с гаплотипом общего предка современных V13, принимая во внимание, что между ними должно быть примерно 3500 лет, это и есть разрыв между «Старой Европой» и «Новой Европой». Ископаемый гаплотип имеет вид

13 24 13 10 16 19 и 13 и 31 16 14 20 10 22

(ископаемый E1b-V13, Испания)

Предковый гаплотип, к которому сходится дерево, в 67-маркерном формате имеет вид

13 24 13 10 16 18 11 12 12 13 11 30–15 9 9 11 11 26