Анатолий Клёсов - ДНК-генеалогия от А до Т

Гаплотип, помеченный X, комфортно сидит на ветви дерева в ближайшем окружении ряда гаплотипов, которые представляют дилемму – или X относится к М269*, или к нижестоящему субкладу R1b-U106. Такая возможность была проверена, построив дерево из 829 гаплотипов субклада U106 в 67-маркерном формате, и добавив к нему представленный гаплотип.

Дерево из 829 гаплотипов субклада U106 в 67-маркерном формате, к которым добавлен представленный для экспертизы гаплотип, обозначенный индексом X. Все гаплотипы дерева имеют общего предка, который жил 3780 ± 380 лет назад (практически та же датировка, в пределах погрешности расчетов, что для 111-маркерных гаплотипов, 3580 ± 360 лет назад). Ветвь справа наверху из 15 гаплотипов, в которую входит гаплотип X, имеет общего предка, который жил 3000 ± 370 лет назад. Гаплотипы взяты из проекта [236] https://www.familytreedna.com/public/U106?iframe=yresults

Базовый (предковый) гаплотип ветви, в которую входит гаплотип X, имеет вид

13 23 14 11 11 14 12 12 12 13 13 29 – 179 10 11 11 24

15 19 2915 15 17 17– 11 10 19 23 1715 17 17 36 39

1212–11 9 15 16 8 10 10 8 10 10 12 2223 16 10 12

12 15 8 12 22 20 13 12 11 13 11 11 13 12

в нем отмечены и мутаций от представленного гаплотипа. Как мы видим, представленный гаплотип ближе к соответствующей ветви субклада U106, чем субклада М269*. Это не означает, что отнесение гаплотипа завершено, но это показывает, что нашему коллеге желательно протестироваться на субклад U106.

Фрагмент диаграммы субкладов гаплогруппы R1b, содержащий цепочку снипов от U106 до Z12

Поскольку субклад U106 в основном западноевропейский, с наибольшей частотой встречается в Германии, то его исследованию в литературе было уделено особое внимание, поскольку исследователи – в основном западноевропейцы и их потомки.

Все гаплотипы в его ветви были довольно тщательно изучены на глубокие субклады, правда, в разной степени. Если у коллеги окажется в итоге субклад U106, эта информация поможет в выборе снипов для тестирования.

В заключение – история гаплогруппы и гаплотипа. Начальный этап появления и миграции гаплогруппы R1b описан в предыдущей «истории», вплоть до древнеямной кулыуры, в которой обнаружены ископаемые R1b с датировками 4600–5300 лет назад. На этом пути, возможно, еще в Сибири, образовалась гаплогруппа R1b-M269, примерно 13 тысяч лет назад, но общий предок ныне живущих носителей гаплогруппы М269* жил примерно 7 тысяч лет назад. Остальные не оставили выжившего потомства.

Следующим образовался субклад L23, примерно 6400 лет назад, видимо, уже на Урале или немедленно после него. Пройдя до Средней Волги и охватив окружающие регионы, эрбины, носители гаплогруппы R1b-M269-L23, пошли на юг, через Кавказ, в Месопотамию. Затем они прошли длинным кружным путем в Европу, образуя на этом пути субклады L51 и L151, и уже на Пиренейском полуострове образовался субклад U106, параллельно с субкладом Р312. Они и составили первую волну культуры колоколовидных кубков, которая заселила континентальную Европу и Британские острова между 4800 и 3500 лет назад.

В настоящее время носители гаплогруппы R1b насчитывают примерно 60 % мужского населения Западной и Центральной Европы. В современной России гаплогруппы R1b относительно немного, около 5 %, и это в основном древние субклады, М269*, L23 и L23-Z2103, причем последний – в значительной степени потомок древнеямной культуры, которая датируется археологами в основном временами 5000–6000 лет назад. Если у нашего коллеги тестирование все-таки выявит М269*, то его ДНК-линия происходит из тех древних времен.

История третья (древний европейский гаплотип давностью 4500 лет)

Представлен 67-маркерный гаплотип:

13 25 15 11 11 11 12 12 12 12 13 28–19 9 10 11 11 25

14 19 29 15 15 16 17–11 11 18 23 15 15 20 16 37 38 11

12 – 11 9 15 16 8 11 10 8 10 10 12 23 23 16 10 12 12 14

8 12 23 20 14 12 11 13 11 11 12 13

Наиболее удаленный известный прямой предок жил в Смоленской области. Сообщено, что выявленный субклад R1b-U152*, то есть, судя по звездочке, он заявлен как терминальный. Также при тестировании ДНК определена серия негативных снипов.

Тестирующая компания несколько перестаралась – достаточно было показать, что негативны снипы L2, Z36 и Z56 (то есть те, что непосредственно под U152), и можно было бы уже не тестировать снипы Z367, Z49, L4 и S47, но, с другой стороны, лучше перетипировать, чем недотипировать. В итоге сделанный вывод был правильный – представленный гаплотип действительно относится к субкладу U152*.

Фрагмент диаграммы субкладов гаплогруппы R1b, содержащий цепочку снипов от М343 до Z145 (нижестоящий от U152)

Перейдем к рассмотрению представленного 67-маркерного гаплотипа, и посмотрим, на какую ветвь дерева гаплотипов гаплогруппы U152 с субкладами он попадет. Это дерево приведено на рисунке, и построено из 425 гаплотипов гаплогруппы U152 в 67-маркерном формате. Представленный гаплотип находится на правой стороне дерева и помечен символом X, на него указывает угол квадратика с символом X. На дереве есть серия молодых (плоских) ветвей, но в искомой ветви таких нет, она – в старой части дерева. Общий предок всего дерева жил 3900 ± 390 лет назад, и эта датировка в точности воспроизвелась для 67– и 111-маркерных гаплотипов. Видно, как точно и надежно откалиброваны контанты скорости мутаций для 67-маркерных (0.12 мутаций на гаплотип на условное поколение) и 111-маркерных (0.198 мутаций на гаплотип на условное поколение). Число мутаций считали от базового (предкового) гаплотипа всего дерева:

13 24 1411 11 1412 12 12 1313 29– 179 10 11 11 25

1519 29 15 15 16 17–11 11 1923 1615 18 17 3638

1212–11 9 15 16 8 1010 8 10 10 12 23 23 16 10 12

12 158 12 2220 1312 11 13 11 11 12 12

Здесь отмечены 19 мутаций по отношению к представленному гаплотипу, что разводит его и базовый гаплотип дерева на 19/0.12 = 158 → 187 условных поколений, или примерно 4675 лет. Это означает, что общий предок этих двух гаплотипов, представленного и предкового, жил примерно (4675 + 3900)/2 = 4290 лет назад. Это согласуется с последними данными расчетов по геному (коллектив YFull), согласно которым субклад U152 возник между 4200 и 4900 лет назад.

Рассмотрим более внимательно ветвь, в которой находится представленный гаплотип, и которая состоит из восьми гаплотипов. На все гаплотипы приходится 139 мутаций, что дает 139/8/0.12 = 145 → 169 условных поколений, то есть 4225 ± 550 лет до общего предка. Это опять соответствует времени возникновения субкладa U152. Представленный гаплотип среди них является самым древним, потому что он отмечен терминальным снипом U152*. Итак, можно заключить, что представленный гаплотип идет напрямую от древнего общего предка, который жил примерно 4200 лет назад, и на протяжении этого времени в ДНК-линии U152* нашего коллеги не появились (или пока не обнаружены) нисходящие субклады.