Несса Кэри - Мусорная ДНК. Путешествие в темную материю генома
- Название:Мусорная ДНК. Путешествие в темную материю генома
- Автор:
- Жанр:
- Издательство:Лаборатория знаний
- Год:2016
- Город:Москва
- ISBN:978-5-906828-62-0
- Рейтинг:
- Избранное:Добавить в избранное
-
Отзывы:
-
Ваша оценка:
Несса Кэри - Мусорная ДНК. Путешествие в темную материю генома краткое содержание
Расшифровав генетический код, ученые обнаружили, что лишь 2% ДНК несут информацию о белках. А для чего же тогда нужны оставшиеся 98%? Поначалу генетики решили, что это мусор, хлам. Однако совсем недавно стало ясно — все гораздо сложнее, и именно эти «мусорные» области ДНК определяют сложность человеческого организма, его возможные болезни и даже — скорость старения! Здесь — ключи к пониманию эволюции и сущности самой жизни.
Сегодня множество ученых в самых разных лабораториях мира пытаются проникнуть в тайны «мусорной» ДНК, этой темной материи нашего генома. Об их последних результатах — в увлекательной книге английского генетика Нессы Кэри.
Мусорная ДНК. Путешествие в темную материю генома - читать онлайн бесплатно ознакомительный отрывок
Интервал:
Закладка:
14. Yi R, O’Carroll D, Pasolli HA, ZhangZ, Dietrich FS, TarakhovskyA, Fuclis E. Morphogenesis in skin is governed by discrete sets of differentially expressed microRNAs. Nat Genet. 2006 Mar; 38(3):356-62.
15. Crist CG, Montarras D, Pallafacchina G, Rocancourt D, Cumano A, Conway SJ, Buckingham M. Muscle stem cell behavior is modified by microRNA-27 regulation of Pax3 expression. Proc Natl Acad Sci USA. 2009 Aug 11;106(32): 13383—7.
16. Chen JF,Tao Y,Li J, DengZ, YanZ, Xiao X, Wang DZ. MicroRNA-1 and microRNA-206 regulate skeletal muscle satellite cell proliferation and differentiation by repressing Pax7. J. Cell Biol. 2010 Sep 6;190(5):867 79.
17. da Costa Martins PA, Bourajjaj M, Gladka M, Kortland M, van Oort RJ, Pinto YM, Molkentin JD, De Windt LJ. Conditional dicer gene deletion in the postnatal myocardium provokes spontaneous cardiac remodeling. Circulation. 2008 Oct 7; 118(15):1567-76.
18. de Chevigny A, Core N, Follert P, Gaudin M, Barbry P, Béclin C, Cremer H. miR-7a regulation of Pax6 controls spatial origin of forebrain dopaminergic neurons. Nat Neurosci. 2012 Jun 24;15(8):1120-6.
19. Konopka W, Kiryk A, Novak M, Herwerth M, Parkitna JR, Wawrzyniak M, Kowarsch A, Michaluk P, Dzwonek J, Arnsperger T, Wilczynski G, Merkenschlager M, Theis FJ, Köhr G, Kaczmarek L, Schütz G. MicroRNA loss enhances learning and memory in mice. J Neurosci. 2010 Nov 3;30 (44):14835-42.
20. Schaefer A, O’Carroll D, Tan CL, Hillman D, Sugimori M, Llinas R, Greengard P. Cerebellar neurodegeneration in the absence of microRNAs. J Exp Med. 2007 Jul 9;204(7): 1553-8.
21. Pietrzykowski AZ, Friesen RM, Martin GE, Puig SI, Nowak CL, Wynne PM, Siegelmann HT, Treistman SN. Posttranscriptional regulation of BK channel splice variant stability by miR-9 underlies neuroadaptation to alcohol. Neuron . 2008 Jul 31;59(2):274-87.
22. Hollander JA, Ini HI, Amelio AL, Kocerha J, Bali P, Lu Q, Willoughby D, Wahlestedt C, Conkright MD, Kenny PJ. Striatal microRNA controls cocaine intake through CREB signalling В]. Nature. 2010 Jul 8;466(7303): 197-202.
23. Fernandez-Hernando C, Baldàn A. MicroRNAs and Cardiovascular Disease. Curr. Genet. Med. Rep. 2013 Mar; 1(1):30-38.
24. Вот один из обзоров, посвященных данной теме: Suzuki Н, Maruyama R, Yamamoto Е, Kai М. Epigenetic alteration and microRNA dysregulation in cancer. Front Genet. 2013 Dec 3;4:258. eCollection 2013.
25. Kleinman CL, Gerges N, Papillon-Cavanagh S, Sin-Chan P, Pramatarova A, Quang DA, Adoue V, Busche S, Caron M, Djainbazian H, Bemmo A, Fontebasso AM, Spence T, Schwartzentruber J, Albrecht S, Hauser P, Garami M, Klekner A, Bognar L, Montes L, Staffa A, Montpetit A, Berube P, Zakrzewska M, Zakrzewski K, Liberski PP, Dong Z, Siegel PM, Duchaine T, Perotti C, Fleming A, Faury D, Remke M, Gallo M, Dirks P, Taylor MD, Sladek R, Pastinen T, Chan JA, Huang A, Majewski J, JabadoN. Fusion ofTTYHl with theC19MC microRNA cluster drives expression of a brain-specific DNMT3B isoform in the embryonal brain tumor ETMR. Nat Genet. 2014 Jan; 46 (1):39-44.
26. Song SJ, Poliseno L, Song MS, Ala U, Webster K, Ng C, Beringer G, Brikbak NJ, Yuan X, Cantley LC, Richardson AL, Pandolf PP. MicroRNA-antagonism regulates breast cancer sternness and metastasis via TET-family-dependent chromatin remodeling. Ceil. 2013 Jul 18;154(2):311-24.
27. Подробное изложение особенностей данного подхода см. в: Schwarzenbach H, Nishida N, Câlin GA, Pantel K. Clinical relevance of circulating cell-free microRNAs in cancer. Nat Rev Clin Oncol. 2014 Mar; 11(3): 145—56.
28. Chen W, Cai F, Zhang B, Barekati Z, Zhong XY. The level of circulating miRNA-lOb and miRNA-373 in detecting lymph node metastasis of breast cancer: potential biomarkers. Tumour Biol. 2013 Feb; 34(1):455-62.
29. Hong F, Li Y, Xu Y, Zhu L. Prognostic significance of serum mi-croRNA-221 expression in human epithelial ovarian cancer. J. Int. Med. Res. 2013 Feb; 41(1):64-71.
30. Shen J, Liu Z, Todd NW, Zhang H, Liao J, Yu L, Guarnera MA, Li R, Cai L. Zhan M, Jiang F. Diagnosis of lung cancer in individuals with solitary pulmonary nodules by plasma microRNA biomarkers. BMC Cancer. 2011 Aug 24;11:374.
31. Подробнее см. в: http://emedicine.medscape.com/article/233442-overview.
32. Trobaugh DW, Gardner CL, Sun C, Haddow AD, Wang E, Chapnik E, Mildner A, Weaver SC, Ryman KD, Klimstra WB. RNA viruses can hijack vertebrate microRNAs to suppress innate immunity. Nature. 2014 Feb 13;506(7487):245-8.
33. JoplingCL, Yi M, Lancaster AM, Lemon SM, Sarnow P. Modulation of hepatitis C virus RNA abundance by a liver-specific MicroRNA. Science. 2005 Sep 2:309(5740): 1577-81.
1. Краткий перечень лекарств, активнее всего продававшихся за последние годы, см. в: http://www.fiercepharma.com/special-reports/15-best-selling-drugs-2012.
2. Этой сфере посвящено множество блогов. Напр.: http://biop-harmconsortium.com/rnai-therapeutics-stage-a-comeback.
3. Подробнее см. в: http://ghr.nlm.nih.gov/condition/transthyre-tin-amyloidosis.
4. http://investors.alnylam.com/releasedetail.cfm?ReleaseID-805999.
5. Все новости о данной программе можно найти здесь: http://mir-narx.com/pipeline/mirna-MRX34.html.
6. Koval ED, Shaner C, Zhang P, du Maine X, Fischer K, Tay J, Chau BN, Wu GF, Miller TM. Method for widespread microRNA-155 inhibition prolongs survival in ALS-model mice. Hum Mol Genet. 2013 Oct 15; 22(20):4127-35.
7. Ozsolak F, Kapranov P, Foissac S, Kim SW, Fishilevich E, Monaghan AP, John B, Milos PM. Comprehensive polyadenylation site maps in yeast and human reveal pervasive alternative polyadenylation. Celt . 2010 Dec 10; 143(6): 1018-29.
8. Очень хороший обзор, посвященный тому, как антисмысловая экспрессия может регулировать гены: Pelechano V, Stein me tz LM. Gene regulation by antisense transcription. Nat Rev Genet. 2013 Dec; 14(12):880-93.
9. http://www.dmgs.com/cons/fomivirsen-intraocular.html.
10. https://www.bhf.org.uk/heart-matters-online/august-septem-ber-2012/medical/familial-hypercholesterolaemia.aspx.
11. http://www.medscape.com/viewarticle/804574_5.
12. http://www.fda.gov/NewsEvents/Newsroom/PressAnnouncements/ucm337195.htm.
13. http://www.medscape.com/viewarticle/781317.
14. http://www.nature.com/nrd/journal/vl2/n3/full/nrd3963. html.
15. Lindow M, Kauppinen S. Discovering the first microRNA-targeted drug. J Cell Biot. 2012 Oct 29;199(3):407-12.
16. http://www.fiercebiotech.com/story/merck-writes-rnai-punts-sirna-alnylam-175m/2014-01-13.
17. http://www.ficrcebiotech.com/press-releases/rana-therapeu-tics-raises-207-milUon-harness-potential-long-non-coding-rna.
18. http://www.bostonglobe.com/business/ 2014/01 /30/dicer-na-shares-soar-first-day-trading-after-biotech-raises-million-initial-public-offering/mbwMnXBSPsVCUVkGQLc64I/story.html.
19. http://www.dicerna.com/pipcline. php, по состоянию на 14 апреля 2014.
20. http://www.fiercebiotech.com/story/breaking-novartis-slams-brakes-rnai-development-efforts/2014-04-14.
1. Последняя история в этой книге сводит воедино различные находки, сделанные множеством исследователей. Вместо ссылок на каждую публикацию лучше дать ссылку на великолепную обзорную статью: van der Maarel SM, Miller DG, Tawil R, Filippova GN, Tapscott SJ. Facioscapulohumeral muscular dystrophy: consequences of chromatin relaxation. Curr Opin Neurol . 2012 Oct; 25(5):614-20.
2. Впервые это разграничение и это терминологическое новшество ввел Сидни Бреннер (Sidney Brenner).
Приложение
ЗАБОЛЕВАНИЯ ЧЕЛОВЕКА, СВЯЗЫВАЕМЫЕ С МУСОРНОЙ ДНК И УПОМИНАЕМЫЕ В ОСНОВНОМ ТЕКСТЕ КНИГИ
XO-снндром (синдром Тёрнера).Женщины с этим заболеванием имеют лишь одну X-хромосому. Болезнь вызвана неравномерным распределением X-хромосом в развивающихся гаметах. Процесс зависит от особенностей центромеры — одной из мусорных областей генома.
XXX-синдром.Женщины с этим заболеванием имеют три X-хромосомы. Болезнь вызвана неравномерным распределением X-хромосом в развивающихся гаметах. Процесс зависит от особенностей центромеры — одной из мусорных областей генома.
ХХY-снндром (синдром Клайнфельтера).Мужчины с этим заболеванием имеют две X-хромосомы. Болезнь вызвана неравномерным распределением X-хромосом в развивающихся гаметах. Процесс зависит от особенностей центромеры — одной из мусорных областей генома.
IPEX-синдром(синдром иммунной дисрегуляции, полиэндокринопатии и энтеропатии, связанный с X-хромосомой). Аутоиммунное заболевание, вызванное мутацией в области, не кодирующей белки и расположенной на конце гена. Мутация препятствует нормальному процессингу информационной РНК.
Апластическая анемия.Примерно 5% случаев обусловлены мутациями в некоторых из важнейших генов, поддерживающих нужную длину теломер — мусорных участков на концах хромосом.
Атаксия Фридрейха.Вызван экспансией ГАА-повтора в области, не кодирующей белки и находящейся внутри гена [80] «Внутри гена» в данном случае означает «не в начале и не в конце гена». (Прим. перев.)
. Повтор препятствует экспрессии гена, мешая клетке копировать его ДНК в РНК.
Базальная карцинома.Небольшая часть случаев вызвана мутациями в области, не кодирующей белки, которая располагается в начале одного из генов, что приводит к ослаблению экспрессии РНК этим геном.
Болезнь Альцгеймера.Возможно, связана со сверхэкспрессией антисмысловой РНК, которая соединяется с важнейшей информационной РНК, кодирующей фермент BACE1, и стабилизирует ее.
Читать дальшеИнтервал:
Закладка:
![Надежда Алданен - Темные Материи [Dark Matters] II Заговор](/books/1158689/nadezhda-aldanen-temnye-materii-dark-matters-ii-z.webp)
