Джессика Сакс - Микробы хорошие и плохие. Наше здоровье и выживание в мире бактерий

2 “New Germ Strain Takes Heavy Toll”, New York Times, March 22, 1958, 19.

3 Исследования показывают, что 20–30 % из нас – постоянные носители одного из штаммов золотистого стафилококка, живущего у нас в носоглотке. Еще 50–60 % периодически подхватывают и вновь теряют то один, то другой штамм этого микроба. И лишь 10–20 % счастливцев обходятся совсем без него. Имеются также данные, указывающие на то, что эта изменчивость связана с врожденными различиями в иммунных веществах, содержащихся в выделениях нашего носа. См.: J. Kluytmans et al., “Nasal Carriage of Staphylococcus aureus: Epidemiology, Underlying Mechanisms, and Associated Risks”, Clinical Microbiology Reviews 10 (1997), 505–520.

4 В 1957 и 1958 гг. младенческая смертность в США впервые с 1936 г. возросла: со 108 000 смертей (26,0 на тысячу живых новорожденных) в 1956 г. до 112 000 (26,3 на тысячу новорожденных) в 1957 г. и 114 000 (27,1 на тысячу) в 1958 г. Затем этот показатель вновь начал постепенно снижаться и стал ниже, чем был в 1956 г., в 1961 г. (25,3 на тысячу). U. S. Census Bureau, Live Births, Deaths, Infant Deaths, and Maternal Deaths: 1900 to 2001, Statistical Abstract No. HS-13. (По смертности, связанной с отдельными микробами, статистика отсутствует.)

5 M. Barber, “Methicillin-Resistant Staphylococci”, Journal of Clinical Pathology 1 (1963), 308–311.

6 Интервью, взятые автором у Хайнца Айхенвальда в январе 2005 г. и в августе 2006 г.

7 Все бактерии, за несколькими необычными исключениями, имеют клеточную стенку одного из двух главных типов. Какого именно, можно определить с помощью микроскопа и специального метода окрашивания, который разработал датский физиолог XIX века Ганс Кристиан Грам. Так называемые грамположительные бактерии, по сути, окружены толстым слоем ячеистого вещества пептидогликана. У грамотрицательных бактерий тоже есть стенка из пептидогликана, но она намного тоньше и окружена дополнительной наружной мембраной из липополисахаридов и фосфолипидов.

8 Joshua Lederberg, Esther Lederberg, “Replica Plating and Indirect Selection of Bacterial Mutants”, Journal of Bacteriology 83 (1952), 399–406.

9 Edward Tatum, “Gene Recombination in Escherichia coli”, Cold Spring Harbor Symposia, June 1946; Edward latum and Joshua Lederberg, “Gene Recombination in the Bacterium Escherichia coli ”, Journal of Bacteriology 53 (1947), 673–684.

10 Joshua Lederberg, Luigi Cavalli, Esther Lederberg, “Sexual Compatibility in Escherichia coli”, Genetics 37 (1952), 720–730.

11 Введенный Ледербергом термин “плазмида”, означающий набор внехромосомных бактериальных генов, перекликался с введенным ранее термином “плазмаген”, означавшим внехромосомные гены, находящиеся вне ядра, то есть в цитоплазме, клеток животных и растений. См.: Joshua Lederberg, “Cell Genetics and Hereditary Symbiosis”, Physiological Review 32 (1952), 403–426.

12 Esther Lederberg, Joshua Lederberg, “Genetic Studies of Lysongenicity in Escherichia coli”, Genetics 38 (1953), 51–64.

13 Фаг лямбда впоследствии стал “рабочей лошадью” генной инженерии. Его используют для создания трансгенных форм жизни, вырезая гены у одного организма и встраивая их с помощью этого вируса в другой.

14 Norton Zinder, Joshua Lederberg, “Infective Heredity in Bacteria”, Journal of Bacteriology 64 (1952), 679–699.

15 F. Griffith, “The Significance of Pneumococcal Types”, Journal of Hygiene. 27 (1928), 113–159.

16 Oswald Avery et al., “Studies on the Chemical Nature of the Substance Inducing Transformation of Pneumococcal Types”, Journal of Experimental Medicine 83 (1944), 89–96.

17 В 1958 г. Джошуа Ледерберг разделил с Джорджем Бидлом и Эдуардом Тейтемом Нобелевскую премию за свои открытия, связанные с генетической рекомбинацией (то есть “половой жизнью”) бактерий. В 1968 г. Джошуа и Эстер развелись. В 1978 г. Джошуа стал президентом Рокфеллеровского университета в Нью-Йорке. Эстер осталась профессором Стэнфордского университета, где поддерживала крупнейшую в мире коллекцию бактериальных плазмид, вплоть до 1999 г., когда у нее случился сердечный приступ, сильно пошатнувший ее здоровье. К сожалению, в работах по истории науки во многом умалчивается та немалая роль, которую Эстер сыграла в эпохальных открытиях этой супружеской пары. И Эстер и Джошуа любезно согласились дать мне интервью для этой книги.

18 T. Watanabe, T. Eukasawa, “Episome-Mediated Transfer of Drug Resistance in Enterobacteriacea”, Journal of Bacteriology 81 (1961), 669–678.

19 K. Ochiai et al., “Studies on Inheritance of Drug Resistance Between Shigella Strains and Escherichia coli Strains”, Nihon Iji Shimpo 1861 (1959), 34–46 (на японском языке) и K. Ochiai et al., “Studies on the Mechanism of Development of Multiple Drug Resistant Shigella Strains”, Nihon Iji Shimpo 1866 (1960), 45–50 (на японском языке) цитируются по: Watanabe, Eukasawa, “Episome-Mediated Transfer”.

20 В 2011 г. исследователи открыли группу генов устойчивости к антибиотикам, расположенную посреди так называемого “острова патогенности” – обширного транспозона, передающего целый ряд патогенных свойств, таких как резко усиленный синтез токсинов. См.: S. N. Luck et al., “Ferric Dicitrate Transport System of Shigella flexneri 2a YSH6000 Is Encoded in a Novel Pathogenicity

Island Carrying Multiple Antibiotic Resistance Genes”, Infection and Immunology 69 (2001), 6012–6021.

21 L. M. Mundy et al., “Relationship Between Enterococcal Virulence and Antimicrobial Resistance”, Clinical Microbiology Reviews (October 2000), 513–522.

22 Robert Weinstein, “Nosocomial Infection Update”, Emerging Infectious Diseases 4 (1998), 416–420.

23 ASM News, June 2004 (American Society for Microbiology).

24 R. Leclercq et al., “Plasmid-Mediated Resistance to Vancomycin and Teicoplanin in Enterococcus faecium”, New England Journal of Medicine 319 (1988), 157–161.

25 “Nosocomial Enterococci Resistant to Vancomycin – United States, 1989–1993”, Morbidity and Mortality Weekly Report 42 (1993), 597–599.

26 “Staphylococcus aureus Resistant to Vancomycin – United States

2002”, Morbidity and Mortality Weekly Report, July 5, 2002.

27 “Brief Report: Vancomycin-Resistant Staphylococcus aureus – New York 2004”, Morbidity and Mortality Weekly Report, April 23, 2004.

28 Оксазолидиноны не позволяют бактериальным рибосомам запускать синтез белка, блокируя присоединение к ним молекул матричной РНК, в которых содержатся инструкции, определяющие порядок присоединения разных аминокислот друг к другу при синтезе белковой молекулы.

29 Neil Woodford et al., “Detection of Oxazolidinone-Resistant Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium Strains by Real-Time PCR and PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism Analysis”, Journal of Clinical Microbiology 40 (2002), 4298–4300.

30 R. Devasia et al., “The First Reported Hospital Outbreak of Linezolid-Resistant Enterococcus: An Infection Control Problem Has Emerged”, Infectious Disease Society of America Meeting 2005, abstract 1079.

31 Curtis Donskey et al., “Effect of Parenteral Antibiotic Administration on Persistence of Vancomycin-Resistant Enterococcus faecium in the Mouse Gastrointestinal Tract”, Clinical Infectious Disease 180 (1999),

384-390.

32 Curtis Donskey et al., “Effect of Antibiotic Therapy on the Density of Vancomycin-Resistant Enterococci in the Stool of Colonized Patients”, New England Journal of Medicine 343 (2000), 1925–1932.

33 Michelle Hecker et al., “Unnecessary Use of Antimicrobials in Hospitalized Patients: Current Patterns of Misuse with an Emphasis on the Antianaerobic Spectrum of Activity”, Archives of Internal Medicine 163 (2003), 972–978.

34 “Severe Clostridium difficile – Associated Disease in Populations Previously at Low Risk – Four States, 2005”, Morbidity and Mortality Weekly, December 2, 2005.

35 R. Viscidi et al., “Isolation Rates and Toxigenic Potential of Clostridium difficile Isolates from Various Patient Populations”, Gastroenterology 81 (1981), 5–9; L. V. McFarland et al., “Nosocomial Acquisition of Clostridium difficile Infection”, New England Journal of Medicine 320 (1989), 204–210.

36 Paul Byrne, “Toenail Surgery Nearly Killed Me, Jamie-Lee, 15, One of Youngest Victims”, Mirror [U. K.], August 30, 2005; “Hospital Blamed for Mum’s Horrible Death”, Windsor Express [U. K.], March 31, 2006.

37 Vivian Loo et al., “A Predominantly Clonal Multi-Institutional Outbreak of Clostridium difficile – Associated Diarrhea with High Morbidity and Mortality”, New England Journal of Medicine 353 (2005), 2442–2449.