Анатолий Клёсов - ДНК-генеалогия от А до Т

13 12 23 10 14 13

13 12 24 9 14 14

и общий предок тех монгольских гаплотипов жил 13700 ± 3700 лет назад [142] Там же. . Это еще раз показывает, уже фактически на количественном уровне, откуда пришли предки современных американских индейцев. Возможно, в этой связке упрятано сходство чукотско-камчатских языков с языками на-дене, одними из многих языков «нативных американцев».

Дерево из 117 гаплотипов американских индейцев субклада Q1a2a1a1-M3 в6 -маркерном формате. Как часто происходит с древними популяциями, деревья их гаплотипов состоят из ряда плоских ветвей, прошедших бутылочные горлышки и недавно выживших. Но сами ветви настолько разбросаны, что из общий предок уходит в глубину времен очень далеко.

Общий предок данного дерева жил 16300 ± 3300 лет назад [143] Klyosov, А.А. (2009) DNA Genealogy, mutation rates, and some historical evidences written in Y-chromosome. II. Walking the map. J. Genetic Genealogy, 5,217–256, и ссылки там же. .

Среди наших современников носители гаплогруппы R* (то есть не считая носителей нижестоящих субкладов) пока не найдены. Это – обычная ситуация для древних гаплогрупп. Вероятность ДНК-линии продержаться без мутаций, нисходящих к мутации десятки тысяч лет назад, крайне мала. Напомним, что мутация во фрагменте Y-хромосомы размером 10 миллионов нуклеотидов происходит, в среднем раз в 144 года, гаплогруппа R образовалась примерно 31300 лет назад, и «под ней» до настоящего времени находятся около двухсот необратимых снип-мутаций. У кого-то их больше, у кого-то меньше, что является отражением статистики мутаций, но так, чтобы у кого-то не проскочило ни одной мутации – таких должно быть очень мало. Хотя наверняка есть, среди десятков миллионов, если не сотен миллионов носителей гаплогруппы R1b с субкладами.

Гаплогруппе R уделяется в исследованиях особое внимание, как предковой гаплогруппе «внуков» – гаплогрупп R1a и R1b, которые преобладают в Восточной и Западной Европе, соответственно.

Поэтому находка древних костных остатков неподалеку от Байкала, рядом с селением Мальта, с археологической датировкой 24 тысячи лет назад, ДНК которых показало гаплогруппу R, стало настоящей мировой сенсацией. Кости принадлежали, как было установлено, 4-летнему мальчику. Автор этой книги предсказывал сибирское происхождение гаплогруппы R1b и ее предков еще в 2012 году, как и последующие миграции гаплогруппы R1b из Сибири (что есть часть Центральной Азии) на запад, до Европы, и об этом даже название статьи [144] Klyosov, А. А. (2012) Ancient history of the Arbins, bearers of haplogroup R1b, from Central Asia to Europe, 16,000 to 1500 years before present. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 87-105. , но сейчас не об этом речь. Речь о том, что в угаре этой сенсации в средствах массовой информации, особенно на Западе, пошли самые фантастические теории о том, как эта гаплогруппа оказалась в Сибири, и какова ее роль в заселение Америки. На самом деле роли не было никакой, гаплогруппы R среди коренных американцев, то есть американских индейцев, нет, и предки байкальского мальчика или потомки тех предков с территории современной Мальты в Америку не ходили. Ходили носители гаплогруппы Q, а у R и Q – один общий предок, гаплогруппа Р. Поэтому геномы носителей гаплогрупп Q и R, по сути братьев, должны быть весьма похожи. Геномный анализ, понятно, так и показал, что геном мальчика из Мальты на 14–38 % похож на геном современных американских индейцев [145] Raghavan, M., Skoglund, R, Graf, K.E., Metspalu, M., A1brechtsen, A., Moltke, I., Rasmussen, S., Stafford, T.W., Orlando, L., Metspalu, E., Karmin, M., Tambets, K., Rootsi, S., Mägi, R., Campos, RF. et al (2013) Upper Palaeolithic Siberian genome reveals dual ancestry of Native Americans. Nature 505, 87–91. .

Но авторы, как обычно для популяционных генетиков, не посмотрели на гаплогруппы, что у индейцев она преобладающе Q, а у древнего байкальца – R. Потому и валом пошли сообщения, что найдены предки американских индейцев, и это европейцы, потому что именно в Европе находится много гаплогруппы R1b, производной от R. Пошли сообщения, что у русских 13 % генома сходно с американскими индейцами, а значит, там, в древней Америке, генетические корни русских, или напротив, в России генетические корни американских индейцев. А генетики опять не могли сообразить, что никаких корней русских в Америке нет, как и наоборот, просто гаплогруппа Р является предковой как для русских гаплогруппы R1a, так и для индейцев гаплогруппы Q, только и всего. Иначе это как рассуждать так, что я произошел от своего дяди (или наоборот), потому что мой геном похож на геном дяди, и все потому, что у нас общий дедушка.

Но, казалось бы, генетики должны такие случаи различать, или хотя бы об этом думать, и каждый раз выдвигать и обсуждать альтернативные объяснения. Но, к сожалению, популяционные генетики такого не делают, и на гаплогруппы с субкладами не смотрят. То есть они их приводят в статьях (и то не всегда), но в анализ их не включают. Основной принцип, с которым работают популяционные генетики, и который стал полностью определяющим при геномном анализе, является принцип «похожести».

Как это работает, и к чему это приводит? Давайте рассмотрим, это очень важно для понимания, чего стоит современный «геномный анализ» в популяционной генетике.

Главная проблема в геномном анализе – это рассортировать фрагменты ДНК от разных людей так, чтобы отличить закономерные сходства фрагментов от случайных. Закономерные сходства наблюдаются тогда, когда фрагменты ДНК этих людей происходят от недавнего общего предка, где понятие «недавний» определяется поставленной задачей. Такие совпадения называют «идентичные по происхождению» (ИПП). В других случаях совпадения являются случайными, по статистическим причинам. Такие совпадения называют «идентичные по сходству» (ИПС). В категорию ИПС попадают также фрагменты ДНК, которые сходны не случайно, а отвечают за важные функции жизнедеятельности человека, которые сформировались и устоялись в результате эволюции человека. В категорию ИПС попадают также фрагменты ДНК, которые веками циркулируют в рамках определенного этноса, особенно если этнос относительно замкнутый (как, например, в еврейских сообществах прошлого).

Суть геномного анализа состоит в том, чтобы сопоставить ДНК от разных людей (если речь о геномном анализе человека), при том, что ДНК людей похожи буквально на 99 %, и что ДНК испещрены мутациями, то есть заменами одних нуклеотидов на другие, и таких замен в ДНК миллионы. В итоге сравниваются доли процентов различий на фоне более 99 % сходства. Но эти сравнения невозможно производить, пользуясь целыми, интактными молекулами ДНК, они производятся после расщепления ДНК на фрагменты разного размера, и компьютер ищет «матчи», то есть совпадения. «Матчи» имеют разную природу. Одни похожи потому что происходят от одного, сравнительно недавнего общего предка (идентичность по происхождению, ИПП), другие похожи по другим причинам (идентичность по сходству, ИПС), не имеющим никакого отношения к общему происхождению. Или имеющим лишь косвенное отношение, например, потому что отражают близкое этническое происхождение, но по комбинации происхождения по мужской и женской линии, где общего предка нет в принципе. В итоге компьютер, подчиняясь определенным программам, которых в интерпретации ДНК используется множество, сортирует фрагменты по разным критериям одновременно – по числу снипов, по размерам фрагментов, по степени сходства, и ни в одном варианте нет однозначных критериев. Фрагменты бывают «крупные», «менее крупные», «более средние», «менее средние», «умеренно малые», «малые», и всех между ними, а и компьютер сам решает, кто кому родственник «по наследственности», а кто «просто похож».