Крейг Вентер - Жизнь на скорости света. От двойной спирали к рождению цифровой биологии

Crick, Francis (1981). Life Itself: Its Origin and Nature . New York: Simon and Schuster. ISBN0–671–25562–2.

Price, C. C. Chem. Eng. News, 43 (39), стр. 90 (1965).

Miller, Stanley L. (мaй 1953). “Production of Amino Acids Under Possible Primitive Earth Conditions.” Science 117 (3046), стр. 528–529.

Oro, J., and A. Р. Kimball (август 1961). “Synthesis of purines under possible primitive earth conditions. I. Adenine from hydrogen cyanide.” Archives of Biochemistry and Biophysics 94, стр. 217–227. Oro, J., and S. S. Kamat (апрель 1961). “Amino-acid synthesis from hydrogen cyanide under possible primitive earth conditions.” Nature 190 (4774), стр. 442–443. Oro, J. (Fox, S. W., ed.). Origins of Prebiological Systems and of Their Molecular Matrices . New York Academic Press, 1967, стр. 137.

http://cshperspectives.cshlстр. org/content/4/7/a006742

Wöese, Carl. The Genetic Code . New York: Harper and Row, 1967.

Kruger, K., Р. J. Grabowski, A. J. Zaug, J. Sands, D. E. Gottsch-ling, T. R. Cech (ноябрь 1982). “Self-splicing RNA: autoexcision and autocyclization of the ribosomal RNA intervening sequence of Tetrahymena .” Cell 31 (1), стр. 147–157.

Guerrier-Takada, C., K. Gardiner, T. Marsh, N. Pace, S. Altman (1983). “The RNA moiety of ribonuclease P is the catalytic subunit of the enzyme.” Cell 35 (3 Pt 2), стр. 849–857.

Нобелевская премия 1989 года по химии была вручена Томасу Чеку и Сиднею Альтману «за открытие ими каталитических свойств РНК».

За свежим обзором я отсылаю читателей к David Deamer. First Life: Discovering the Connections Between Stars, Cells and How Life Began (University of California Press, 2011).

Джек Шостак был награжден Нобелевской премией 2009 года по физиологии и медицине вместе с Элизабет Блэкбёрн и Кэрол Грейдер за открытие теломерной защиты хромосом.

Szostak, Jack W., David P. Bartel, and Р. Luigi Luisi. “Synthesi-zing life.” Nature 409, стр. 387–390 (18 января 2001).

Рич Робертс, ныне работающий в New England Biolabs , разделил Нобелевскую премию 1993 года по физиологии и медицине с Филипом Шарпом за открытие интронов в ДНК эукариотов и механизма генного сплайсинга.

Chen, I. A., R. W. Roberts, J. W. Szostak. “The emergence of competition between model protocells.” Science , 3 сентября 2004, 305, стр. 1474–1476.

Isselbacher, Kurt J. “Paul C. Zamecnik (1912–2009).” Science , 4 декабря 2009, 326 (5958), стр. 1359.

Nirenberg, M. W., and H. J. Matthaei (1961). “The Dependence Of Cell-Free Protein Synthesis In E. coli Upon Naturally Occurring Or Synthetic Polyribonucleotides.” Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 47 (10), стр. 1588–1602.

Shimizu, Y., et al. (2001). “Cell-free translation reconstituted with purified components.” Nat. Biotechnol. 19, стр. 751–755.

Baldwin, Geoff, Travis Bayer, Robert Dickinson, Tom Ellis, Paul S. Freemont, Richard I. Kitney, Karen Polizzi, and Guy-Bart Stan. Synthetic Biology: A Primer . Imperial College Press, London, 2012, стр. 142.

Srivastava, Mansi, Oleg Simakov, Jarrod Chapman, Bryony Fahey, Marie E. A. Gauthier, Therese Mitros, Gemma S. Richards, Cecilia Conaco, Michael Dacre, Uffe Hellsten, Claire Larroux, Nicholas H. Putnam, Mario Stanke, Maja Adamska, Aaron Darling, Sandie M. Degnan, Todd H. Oakley, David C. Plachetzki, Yufeng Zhai, Marcin Adamski, Andrew Calcino, Scott F. Cummins, David M. Goodstein, Christina Harris, Daniel J. Jackson, et al. “The Amphimedon queenslandica genome and the evolution of animal complexity.” Nature 466, стр. 720–726 (5 августа 2010). DOI: 10.1038/nature09201

K. W. Jeon, I. J. Lorch, and J. F. Danielli. “Reassembly of Living Cells from Dissociated Components.” Science , 20 марта 1970, 167 (3925), стр. 1626–1627.

Darwin, Charles. On the Origin of Species (1859).

http://ec.europa.eu/information_society/activities/health/docs/projects/fp7/vph_projects_portofolio_2011.pdf

Noble, D. “Cardiac Action and Pacemaker Potentials based on the Hodgkin-Huxley Equations.” Nature 188, стр. 495–497 (5 ноября 1960).

Noble, D. “From the Hodgkin – Huxley axon to the virtual heart.” J. Physiol., 1 апреля 2007, 580 (1), стр. 15–22. Предпечатная публикация 5 октября 2006. DOI: 10.1113/jphysiol.2006.119370

http://www.humanbrainproject.eu/

http://europa.eu/rapid/press-release_IP-13–54_en.htm

Ishii, Nobuyoshi, Kenji Nakahigashi, Tomoya Baba, Martin Robert, Tomoyoshi Soga, Akio Kanai, Takashi Hirasawa, Miki Naba, Kenta Hirai, Aminul Hoque, Pei Yee Ho, Yuji Kakazu, Kaori Sugawara, Saori Igarashi, Satoshi Harada, Takeshi Masuda, Naoyuki Sugiyama, Takashi Togashi, Miki Hasegawa, Yuki Takai, Katsuyuki Yugi, Kazuharu Arakawa, Nayuta Iwata, Yoshihiro Toya, Yoichi Nakayama, Takaaki Nishioka, Kazuyuki Shimizu, Hirotada Mori, and Masaru Tomita. “Multiple High-Throughput Analyses Monitor the Response of E. coli to Perturbations.” Science 316, 27 апреля 2007 (5824), стр. 593.

http://wholecell.stanford.edu/

http://wholecellkb.stanford.edu/

Nierman, W. C., T. V. Feldblyum, M. T. Laub, I. T. Paulsen, K. E. Nelson, J. A. Eisen, J. F. Heidelberg, M. R. Alley, N. Ohta, J. R. Maddock, I. Potocka, W. C. Nelson, A. Newton, C. Stephens, N. D. Phadke, B. Ely, R. T. DeBoy, R. J. Dodson, A. S. Durkin, M. L. Gwinn, D. H. Haft, J. F. Kolonay, J. Smit, M. B. Craven, H. Khouri, J. Shetty, K. Berry, T. Utterback, K. Tran, A. Wolf, J. Vamathevan, M. Ermolaeva, O. White, S. L. Salzberg, J. C. Venter, L. Shapiro, and C. M. Fraser. “Complete genome sequence of Caulobacter crescentus .” Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 27 марта 2001, 98 (7), стр. 4136–4141. Erratum in Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 22 мая 2001, 98(11), стр. 6533. Eisen, J. [corrected to Eisen, J. A.].

Christen, Beat, Eduardo Abeliuk, John M. Collier, Virginia S. Kalogeraki, Ben Passarelli, John A. Coller, Michael J. Fero, Harley H. McAdams, and Lucy Shapiro. “The essential genome of a bacterium.” Molecular Systems Biology 7, article number: 528.

Baldwin, Geoff, Travis Bayer, Robert Dickinson, Tom Ellis, Paul S. Freemont, Richard I Kitney, Karen Polizzi, and Guy-Bart Stan. Synthetic Biology: A Primer . Imperial College Press, London, 2012.

Gardner, T. S., C. R. Cantor, and J. J. Collins (20 января 2000). “Construction of a genetic toggle switch in Escherichia coli .” Nature 403 (6767), стр. 339–342.

Tabor, J. J., H. Salis, Z. B. Simpson, A. A. Chevalier, A. Levskaya, E. M. Marcotte, C. A. Voigt, and A. D. Ellington. “A Synthetic Genetic Edge Detection Program.” Cell , 137 (7), стр. 1272–1281 (2009).

Danino, Tal, Octavio Mondragon-Palomino, Lev Tsimring, and Jeff Hasty. “A synchronized quorum of genetic clocks.” Nature 463, стр. 326–330 (21 января 2010).

www.clothocad.org

Baldwin, Geoff, Travis Bayer, Robert Dickinson, Tom Ellis, Paul S. Freemont, Richard I. Kitney, Karen Polizzi, Guy-Bart Stan. Synthetic Biology: A Primer . Imperial College Press, London, 2012, стр. 121.

http://www.jbioleng.org/content/2/1/8

Parasight, Imperial College London.

Baldwin, Geoff, Travis Bayer, Robert Dickinson, Tom Ellis, Paul S. Freemont, Richard I. Kitney, Karen Polizzi, Guy-Bart Stan. Synthetic Biology: A Primer . Imperial College Press, London, 2012, стр. 121.

http://www.nature.com/nbt/journal/v29/n3/full/nbt.1802.html

http://www.nature.com/nnano/journal/v7/n6/full/nna№ 2012.65.html

http://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2012/lc/c2lc40098g

Noireaux, V., R. Bar-Ziv, and A. Libchaber (2003). “Principles of cell-free genetic circuit assembly.” PNAS1 00, стр. 12672–12677.

http://library.cshl.edu/oralhistory/interview/cshl/research/zing-finger-proteins-discovery-and-application/

Miller, J., A. D. McLachlan, A. Klug (Июнь 1985). “Repetitive zinc-binding domains in the protein transcription factor IIIA from Xenopus oocytes .” EMBO J. 4 (6), стр. 1609–1614.

Khalil, Ahmad S., Timothy K. Lu, Caleb J. Bashor, Cherie L. Ramirez, Nora C. Pyenson, J. Keith Joung, James J. Collins. “A Synthetic Biology Framework for Programming Eukaryotic Transcription Functions.” Cell , 3 августа 2012, Vol. 150, Issue 3, стр. 647–658.

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867412007805

http://www.synbiosafe.eu/uploads///pdf/Synthetic%20Genomics%20Options%20for%20Governance.pdf

http://www.edinethics.co.uk/synbio/synbio%20democs%20report.pdf http://www.nuffieldbioethics.org/emerging-biotechnologies

“Bridging Science and Security for Biological Research:

A Discussion about Dual Use Review and Oversight at Research Institutions. Отчет о встрече 13–14 сентября 2012.” American Association for the Advancement of Science in conjunction with the Association of American Universities, Association of Public and Land-Grant Universities, and the Federal Bureau of Investigation.

http://www.biofab.org/

Wohlsen, Marcus. Biopunk: DIY Scientists Hack the Sofware of Life . Current, New York, 2011. стр. 65 и 155.