Карин Мёллинг - Вирусы: Скорее друзья, чем враги

CRISPR/Cas9 – короткие палиндромные кластерные повторы с регулярными промежуточными пространствами / CRISPR-ассоциированный белок 9; это противовирусная система защиты от внедрения ДНК-содержащих фагов в бактерии и археи. Данная технология используется для удаления и модификации генов, называется «редактирование» и является новым методом, предусматривающим очень серьезные потенциальные изменения генов во всех видах. Метод прост в использовании и отличается быстродействием и низкой ценой, не предполагает применения рекомбинантных механизмов, поскольку «направляющая» РНК «предназначает» новую последовательность, которая затем копируется (редактируется). Метод не предусматривает генетическую модификацию ДНК, не подпадает под законодательство, регулирующее ГМО; по этому поводу возникают этические споры.

CXCR4 или CCR5 – рецепторы, локализующиеся на лимфоцитах, которые позволяют поверхностным гликопротеинам ВИЧ (gp120) связываться и проникать в клетку на ранней и поздней стадиях заболеваний.

EHEC (энтерогеморрагический штамм кишечной палочки) – бактерия Escherichia coli, вызывающая энтерогеморрагические заболевания; является следствием фаг-опосредованного приобретения токсина (токсин Шига), который находится в фекалиях животных и удобрениях. Бактерия опасна для здоровья человека – ростки, зараженные EHEC, вызвали в Германии самый крупный скандал [22] Скандал произошел летом 2011 г., в результате отравления погибли около 50 человек. – Прим. ред. , связанный с пищевыми продуктами.

EMBO – Европейская организация по молекулярной биологии, находится в Гейдельберге (Германия), занимается проведением научных мероприятий на высоком уровне, семинаров, учреждает стипендии, осуществляет подготовку специалистов как из Европы, так и из других стран мира.

EMEA – Европейское агентство по оценке лекарственных средств, занимающееся оценкой медицинских продуктов, защитой здоровья животных и человека, дает разрешение на проведение клинических исследований. До недавнего времени называлось EMA (Европейское агентство лекарственных средств).

Emiliania huxleyi – морские водоросли, содержащие углерод (кокколитофы), сокращенно называются EH, в зависимости от климата могут образовывать огромные светящиеся «поляны», являются носителями вирусов морских водорослей EhV или EHV, в результате лизирующего действия которых водоросли перестают светиться, что является стрессовой реакцией на снижение температуры и приводит к повторному использованию питательных веществ.

Erb-B2 или HER2/neu – онкоген (рак-промотирующий ген) вируса эритробластоза у цыплят, рецептор эпидермального фактора роста, который стимулирует пролиферацию клеток за счет задействования сигнального каскада Ras-MAP-киназы, характеризуется сверхэкспрессией, является индикатором рака молочной железы у человека. У 25% пациенток с раком молочной железы отмечаются мутации Erb-B2.

ERV – эндогенный ретровирус, ДНК которого интегрирована в геном эукариотов; наследуется как ДНК провируса через зародышевые клетки. Этот ретровирус более не является инфекционным и часто бывает дефектным. Возникает при заражении зародышевых клеток ранее не инфекционными вирусами, которые часто относятся к вымершим; обеспечивает противовирусную защиту от аналогичных вирусов. В настоящее время в реальном времени происходит эндогенизация данного вируса в организме коал, которые отождествляются с законсервированными (устойчивыми) сайтами интеграции, в то время как новые инфицирующие вирусы интегрируются на случайных сайтах (см. Phoenix).

ETH (Eidgenössische Technische Hochschule) – Швейцарский федеральный технологический институт (Цюрих), также называемый политехническим, является одним из ведущих европейских университетов.

FTO – белок, ассоциированный с жировой массой тела и ожирением, один из нескольких генов, ассоциированных с ожирением; ген имеет 47 000 нуклеотидов; это не один белок, а много вариантов из-за различного сплайсинга; действует совместно с транскрипционным фактором IXR3, ассоциированным с ожирением.

gag – один из ретровирусных генов, групп-специфический антиген; название основано на иммунологии вирусов.

GALV – вирус лейкоза гиббона, обезьяний вирус, убивший большое количество коал, прежде чем их организм выработал резистентность к данному вирусу путем эндогенизации.

Gypsy – название ретротранспозона, который очень напоминает ретровирус и присутствует у дрозофил, эквивалентен Ty3 в дрожжах, содержит длинные концевые повторы (LTR-последовательности), gag, pol, нуклеазу, интегразу, но не содержит ген env; может осуществлять перенос генов.

HBV – вирус гепатита В, параретровирус, который реплицируется при помощи обратной транскриптазы, но в вирусных частицах упакована ДНК, а не РНК, что в ряде случаев приводит к развитию гепатоцеллюлярной карциномы. Существует соответствующая вакцина.

HCV – вирус гепатита С. На поздней стадии заболевания может вызвать гепатоцеллюлярную карциному. Существует новая терапия (дорогостоящая – $50 000), которая весьма эффективно уничтожает вирус.

HDV – редкий вирус гепатита дельта, инфицирующий печень человека, рибозим, возможно, растительного происхождения. Вместе с HBV вызывает тяжелое заболевание.

HERV – эндогенные ретровирусы человека. В геноме человека содержится примерно 450 000 копий. Редко формируют инфекционные частицы и напрямую не коррелируются с развитием заболеваний, однако благодаря своим промоторам LTR-последовательностям могут влиять на соседние гены. Известно, что они играют роль в развитии рака и генетических заболеваний с неизвестной частотой. Представляют собой остаток бывших ретровирусных инфекций зародышевых клеток.

INRA – Французский национальный институт сельскохозяйственных исследований, расположенный в окрестностях Парижа, относится к числу передовых институтов в сфере анализа микробиома.

iPS-клетки – индуцированные плюрипотентные стволовые клетки; обновленный фибробласт взрослого человека или другие дифференцированные клетки путем применения набора из четырех транскрипционных факторов (Oct3/4, Sox2, Kif4 и c-Myc), индуцирующих пролиферацию и де-дифференциацию, один из четырех протоонкогенов – вирусный «онкоген» Myc; iPS похожи на эмбриональные стволовые (ЭС) клетки, которые не имеют специализации и сохраняют плюрипотентность; для целей исследования iPS-клетки заменяют ЭС-клетки, получение которых запрещено. iPS-клетки способны развиться в одну из 200 специализированных клеток человека, в частности в клетки головного мозга, нервные клетки, клетки мышечной ткани; есть надежда на то, что можно регенерировать мертвые или больные ткани для их замены.

IRX3 – транскрипционный фактор, который наряду с FTO связан с ожирением.