Карин Мёллинг - Вирусы: Скорее друзья, чем враги

Супрессор опухоли – гены и белки, выполняющие антипролиферативную функцию; их потеря способствует развитию рака; ингибируют рост клетки; противодействуют онкогенам, часто удаляются онкогенными белками, повышая онкогенность; потеря супрессора опухоли часто является одним из ключевых явлений при формировании опухоли, и его замена с помощью генной терапии может иметь некоторую эффективность в лечении рака. Вирусы способны титровать белки супрессора опухоли для более продолжительной жизни клетки и получения большего числа потомков.

Теломераза – теломерная обратная транскриптаза (ТОТ или TERT), которая использует свои короткие РНК как эндогенный шаблон и копирует их в количестве нескольких тысяч копий, пролонгируя таким образом концы ДНК или хромосом (теломер); активна в период эмбриогенеза и в опухолях; в нормальной клетке теломеразная активность отключена и хромосомы укорачиваются на концах при каждом этапе клеточного деления; своего рода молекулярные часы; этот фермент – мишень противораковой терапии и терапии, направленной против старения; старение клеток происходит несинхронно, поэтому длина теломер не является предсказуемым маркером для прогнозирования продолжительности жизни организма.

Трансгенерационная генетика – унаследованные эпигенетические химические изменения генов и хроматина без мутаций, индуцированные факторами среды; носят более долгосрочный характер, чем эпигенетические изменения, сохраняются в течение нескольких и даже многих поколений; память у C. elegans индуцируется с помощью piРНК и сохраняется в течение 30 поколений: черви запоминают запах этилового спирта и половых гормонов; трансгенерационная генетика встречается у растений и мышей; что касается человека, ситуация неясна и данная тема является предметом исследований – как от страдающих ожирением дедушек ожирение передается внукам. См. также парамутация.

Транспозон, или транспозируемый элемент – «прыгающий» ген, который состоит из всех видов элементов, таких как ретроэлементы или ДНК-ретротранспозоны, и действует по принципу «вырезать и вставить», что приводит к двум генотоксическим явлениям, и по принципу «копировать и вставить» для ретротранспозонов, это одно генотоксическое явление, сопровождающееся дупликацией гена. Геном человека примерно на 50% состоит из ТЭ, в геноме кукурузы этот показатель составляет 49–78%, в геноме пшеницы – 90%, в геноме C. elegans – 12%.

Триплет – кодон, образованный тремя нуклеотидами мРНК; каждый кодон специфичен для одной Aк; они собираются на рибосоме с мРНК как матрице для синтеза белка; кодирование белка приводит к образованию белков; некодирующая РНК (нкРНК) выполняет регуляторные функции.

ТЭ – все виды транспозируемых элементов, также «прыгающие» гены.

Умеренный фаг – нелитический, или умеренный фаг, интегрирует свою ДНК в ДНК бактерии-хозяина в качестве ДНК-профага; может индуцироваться стрессом и становиться литическим в силу потери супрессора, что обеспечивает репликацию потомства и разрушение (лизис) клетки.

Утконос – млекопитающее, которое откладывает яйца и не является живородящим. Нос у этого животного похож на утиный клюв, а хвост – на хвост бобра. Эндемичный вид для восточного побережья Австралии, находится на грани вымирания.

Фаги или бактериофаги – чаще всего это вирусы бактерий, имеющих двухцепочечную ДНК; могут иметь шипы; способны интегрироваться, подобно ДНК-профагу, в геном хозяина (ограниченный или лизогенный цикл) или приобрести эписомальный характер, покинув ДНК хозяина и осуществив лизис бактерий (литический цикл) в целях репликации вируса/фага, разновидности вируса; очень широко распространенный вид вируса в океанах, почве, воздухе и т.д.

Фермент Drosha – фермент, содержащий структуру РНКазы Н, разрезает двухцепочечную РНК для процессинга сайленсерной РНК (малая интерферирующая РНК).

Фико-ДНК-вирус – гигантский вирус, крупный икосаэдрический вирус морских водорослей (фико), имеющий двухцепочечную ДНК. Характеризуется выраженным генетическим разнообразием, может быть литическим и лизогенным. Вирус Chlorella может уничтожать цветущие водоросли, как в библейской притче о «красном приливе», влияя на геохимические циклические процессы и погодные паттерны. Патогенность для человека не установлена.

ФП – фекальная передача, трансплантация фекалий от одного человека другому в качестве терапии инфекции, индуцированной С. difficile.

Хроматин – комплекс клеточной ДНК с белками, в частности гистонами, вокруг которых происходит закручивание ДНК; могут изменяться под действием эпигенетических модификаций (в частности, метилирования ДНК и ацетилирования гистона).

Хромосома – генетический материал (геном) эукариотов, который распределяется на линейных ДНК-молекулах с ассоциированными белками, и все вместе это называется хромосомами. У человека 22 общие хромосомы, каждая из которых представлена в двух копиях, и еще две специфические хромосомы, определяемые полом (женские – XX, мужские – XY), – в общей сложности 46 хромосом.

Хронологические этапы развития Земли. 14 млрд лет назад – Большой взрыв; 4,5 –4,0 млрд лет назад – формирование Земли, массивные метеоритные бомбардировки Земли космическими объектами и столкновение с гигантским объектом, что привело к образованию Луны; 4 млрд лет назад – формирование первых биомолекул; 580 млн лет назад – образование многоклеточных организмов; 540 млн лет назад – Кембрийский взрыв, характеризовавшийся появлением огромного разнообразия форм жизни; 380 млн лет назад – появление первых позвоночных; 230 –65 млн лет назад – динозавры; 65 млн лет назад – падение астероида на территории Юкатанского полуострова (современная Мексика), после чего произошло массовое вымирание динозавров; 3,2 млн лет назад – появление австралопитека (Люси) в Африке; 200 000 лет назад – появление Homo sapiens; 200 000–40 000 лет назад – неандертальцы.

Цвет – помогает «увидеть» эффекты мутации, эпи- и парамутации у кукурузы, мышей агути и мышей с белыми хвостами, полоски на тюльпанах, растения в крапинку, полоску и с кольцевой пятнистостью, в веретеновидности клубней картофеля, а также окраске зебр, леопардов и, я полагаю, также декоративных карпов кои. Характер распределения окраски обусловлен взаимовлиянием главным образом двух основных типов клеток, химических соединений, или «морфогенов», активатора и ингибитора; при этом имеют значение такие факторы, как геометрия и частота. В 1952 г. знаменитый английский математик Алан Тьюринг описал это явление при помощи двух дифференциальных уравнений. «Механизм Тьюринга» относится к системе активации–диффузии или к системе «активатор–ингибитор». Вероятно, в ряде случаев в роли активатора выступает вирус, а ингибитора – сайленсерная siРНК, обусловливающая появление белых пятен на петуниях.