Дэвид Райх - Кто мы и как сюда попали [Древняя ДНК и новая наука о человеческом прошлом]

61 Sankararaman et al. “Genomic Landscape”.

62 https://customercare.23andme.com/hc/en-us/articles/212873707Neanderthal-Report-Basics, #13514.

Глава 12. Будущее древней ДНК

1 J. R. Arnold, W. F. Libby. “Age Determinations by Radiocarbon Content – Checks with Samples of Known Age”, Science 110 (1949): 678–680.

2 C. Renfrew. Before Civilization: The Radiocarbon Revolution and Prehistoric Europe (London: Jonathan Cape, 1973).

3 L. R. Binford. In Pursuit of the Past: Decoding the Archaeological Record (Berkeley: University of California Press, 1983).

4 M. Rasmussen et al. “Ancient Human Genome Sequence of an Extinct Palaeo-Eskimo”, Nature 463 (2010): 757–762; M. Rasmussen et al. “The Genome of a Late Pleistocene Human from a Clovis Burial Site in Western Montana”, Nature 506 (2014): 225–229; M. Raghavan et al. “Upper Palaeolithic Siberian Genome Reveals Dual Ancestry of Native Americans”, Nature (2013): doi: 10.1038/nature 12736.

5 P. Skoglund et al. “Genomic Insights into the Peopling of the Southwest Pacific”, Nature 538 (2016): 510–513.

6 J. Dabney et al. “Complete Mitochondrial Genome Sequence of a Middle Pleistocene Cave Bear Reconstructed from Ultrashort DNA Fragments”, Proceedings of the National Academy of Sciences of the U.S.A. 110 (2013): 15758–15763; M. Meyer et al. “A High-Coverage Genome Sequence from an Archaic Denisovan Individual”, Science 338 (2012): 222–226; Q. Fu et al. “DNA Analysis of an Early Modern Human from Tianyuan Cave, China”, Proceedings of the National Academy of Sciences of the U.S.A. 110 (2013): 2223–2227; R. Pinhasi et al. “Optimal Ancient DNA Yields from the Inner Ear Part of the Human Petrous Bone”, PLoS One 10 (2015): e0129102.

7 I. Lazaridis et al. “Genomic Insights into the Origin of Farming in the Ancient Near East”, Nature 536 (2016): 419–424.

8 I. Olalde et al. “The Beaker Phenomenon and the Genomic Transformation of Northwest Europe”, bioRxiv (2017): doi. org/10.1101/135962.

9 P. F. Palamara, T. Lencz, A. Darvasi, I. Pe’er. “Length Distributions of Identity by Descent Reveal Fine-Scale Demographic History”, American Journal of Human Genetics 91 (2012): 809–822; D. J. Lawson, G. Hellenthal, S. Myers, D. Falush. “Inference of population structure using dense haplotype data”, PLoS Genetics 8 (2012): e1002453.

10 S. Leslie et al. “The Fine-Scale Genetic Structure of the British Population”, Nature 519 (2015): 309–314.

11 S. R. Browning and B. L. Browning. “Accurate Non-parametric Estimation of Recent Effective Population Size from Segments of Identity by Descent”, American Journal of Human Genetics 97 (2015): 404–418.

12 M. Lynch. “Rate, Molecular Spectrum, and Consequences of Human Mutation”, Proceedings of the National Academy of Sciences of the U.S.A. 107 (2010): 961–968; A. Kong et al. “Selection Against Variants in the Genome Associated with Educational Attainment”, Proceedings of the National Academy of Sciences of the U.S.A. 114 (2017): E727–732.

13 J. K. Pritchard, J. K. Pickrell, G. Coop. “The Genetics of Human Adaptation: Hard Sweeps, Soft Sweeps, and Polygenic Adaptation”, Current Biology 20 (2010): R208–215.

14 S. Haensch et al. “Distinct Clones of Yersinia pestis Caused the Black Death”, PLoS Pathogens 6 (2010): e1001134; K. I. Bos et al. “A Draft Genome of Yersinia pestis from Victims of the Black Death”, Nature 478 (2011): 506–510.

15 I. Wiechmann, G. Grupe. “Detection of Yersinia pestis DNA in Two Early Medieval Skeletal Finds from Aschheim (Upper Bavaria, 6th Century AD)”, American Journal of Physical Anthropology 126 (2005): 48–55; D. M. Wagner et al. “ Yersinia pestis and the Plague of Justinian 541–543 AD: A Genomic Analysis”, Lancet Infectious Diseases 14 (2014): 319–326.

16 S. Rasmussen et al. “Early Divergent Strains of Yersinia pestis in Eurasia 5,000 Years Ago”, Cell 163 (2015): 571–582.

17 P. Singh et al. “Insight into the Evolution and Origin of Leprosy Bacilli from the Genome Sequence of Mycobacterium lepromatosis ”, Proceedings of the National Academy of Sciences of the U.S.A. 112 (2015): 4459–4464.

18 K. I. Bos et al. “Pre-Columbian Mycobacterial Genomes Reveal Seals as a Source of New World Human Tuberculosis”, Nature 514 (2014): 494–497.

19 K. Yoshida et al. “The Rise and Fall of the Phytophthora infestans Lineage That Triggered the Irish Potato Famine”, eLife 2 (2013): e00731.

20 C. Warinner et al. “Pathogens and Host Immunity in the Ancient Human Oral Cavity”, Nature Genetics 46 (2014): 336–344.

21. T. Higham et al. “The Timing and Spatiotemporal Patterning of Neanderthal Disappearance”, Nature 512 (2014): 306–309.

22 E. Callaway. “Ancient Genome Delivers ‘Spirit Cave Mummy’ to US Tribe”, Nature 540 (2016): 178–179.

Под термином “современные люди” автор подразумевает людей с современным анатомическим строением и поведением; в большинстве случаев имеются в виду сапиенсы, жившие менее 50 тысяч лет назад. Далее в данном переводе, чтобы избежать путаницы, человечество, существующее в настоящее время, называется нынешним, или сегодняшним, или иными синонимами. (Прим. перев.)

Втор. 34: 10.

В 2018 году уран-ториевым методом удалось заново датировать наскальные рисунки из трех пещер Юго-Восточной Испании (Ла-Пасьега, Мальтравиесо и Ардалес); датировки наиболее древних рисунков составили 65 тысяч лет. Это на 20 тысяч лет раньше любых кроманьонских рисунков. Эти и некоторые другие данные подтверждают, что символизм существовал у неандертальцев вне связи с символизмом современных людей. См.: Hoffmann et al., 2018, Science, 359, p. 912–915, Hoffmann et al., 2018, Science Adv., 4, eaar5255. (Прим. перев.)

Имеется в виду: сложные составные орудия, ритуальное поведение, включая погребения, символизм и искусство. (Прим. перев.)

Перевод К. Чуковского.

Ч. Дарвин. Происхождение видов . Гл. 4. Перевод под ред. Некрасова, издание АН СССР, 1939.

“Древняя примесь в генетическом наследии индейцев”.

В действительности это два разных потепления, разделенных периодом относительного похолодания, называемым “древний дриас”. (Прим. перев.)

Имеется в виду зависимость генетического сходства от географической дистанции между сравниваемыми популяциями. (Прим. перев.)

Здесь следует уточнить, что, так как выборка, в которой обнаружилась чумная палочка, включала образцы от Алтая до Эстонии, авторы оригинальной работы (Rasmussen et al., 2015) пишут об “эндемичном евразийском очаге”, а не о степном. (Прим. перев.)

Перевод В. А. Кочергина, 2001.

Автор везде употребляет политкорректное название индейцев native americans. В переводе здесь и далее будет употребляться принятое пока в России старое название “индейцы”. (Прим. перев.)

Автор здесь употребляет новый социополитический термин balkanization, подразумевающий переход от этнонационализма к этносепаратизму. (Прим. перев.)

Метод кластеризации выявляет максимальное сходство, упуская небольшие различия; тест четырех популяций ориентируется на различия. (Прим. перев.)

В 2019 году в Индонезии на соседнем острове Лусон обнаружили скелетные остатки еще одного вида малорослых людей Homo luzonensis; некоторые морфологические признаки указывают на их высокую архаичность. Détroit et al., 2019. (Прим. перев.)

Или макросемью. (Прим. перев.)

Термина “фуражиры” (foragers) в русскоязычной научной литературе нет, есть только термин, обозначающий соответствующий тип хозяйства – “присваивающее”. “Фуражиры” – это фактически синоним “охотников-собирателей”, но в отношении типа хозяйствования, а не образа жизни. (Прим. перев.)

В статье указываются несколько фамилий, составляющих потомков одной династии: O'Neill, O'Gallagher, O'Boyle, O'Doherty, Connor, Cannon, Bradley, O'Reilly, Flynn, McKee, Campbell, Devlin, Donnelly, Egan, Gormley, Hynes, McCaul, McGovern, McLoughlin, McManus, McMenamin, Molloy, O'Kane, O'Rourke, Quinn и O'Donnell; первую из этого списка фамилию упоминает автор книги. (Прим. перев.)

Формула позволяет рассчитать, сколько лет человек потратит на учебу, если известно, какие у него гены. (Прим. перев.)

В 1994 году в Руанде хуту, составлявшие тогда большинство в правительстве, убили от 400 до 700 тысяч тутси, это около 20 % населения страны. (Прим. перев.)