Чарльз Эллис - Эпигенетика

Vaughn M.W., Tanurdzic M., and Martienssen R., 2005. Replication, repair, and reactivation. Dev. Cell 9: 724-725.

Wade P.A. and Wolffe A.P., 1997. Histone acetyltransferases in control. Curr. Biol. 1: R82-R84.

Wade P.A., Pruss D., and Wolffe A.P., 1997. Histone acetylation: Chromatin in action. Trends Biochem. Sci. 22 : 128-132.

Zilberman D. and Henikoff S., 2005. Epigenetic inheritance in Arabidopsis: Selective silence. Curr. Opin. Genet. Dev. 15: 557-562.

4-Фенилбутират (РВА), 460

5-Аза-2’-дезоксицитидин, 459-460

5-Азацитидин, 459-460

Abfl, 76, 81

Absent Small или Homeiotic (ASH)

— семейство, 179, 223, 232, 235-236, 240-242

ACF, компенсация дозы и, 309

Ade2 как репортерный ген у дрожжей, 72-73

Adeb, 109-110 Air ген, 358, 360-361,363

Alcohol dehydrogenase (Adh) трансгены, 99

am гены, RIP и 120

ANT. См. Измененная Ядерная Пересадка (ANT); комплекс Аntennapedia (ANT-С)

Antennapedia (ANT-С) комплекс, 231

Arabidopsis

— Arabidopsis RNAiy, 156-157, 162-165

— веб-сайты с информацией о, 466

— как модельный организм, 35-37

— клеточная пролиферация и, 224

— компоненты эпигенетической регуляции у, 171-177

— организация генома, 54

— формирование гетерохроматина, 101-102

Argonaute белки, 121, 145, 149, 154-156, 162-164, 282, 295, 377

Argonaute-подобные белки, 121, 123, 145, 149,155-156, 163-164, 282,295

Arp. См. Белок 4, родственный актину ASH семейство. См. Absent Small или Homeotic Asm-1, 122-123,282

ATRX ген, 434 Aubergine, 100

BCR, 393, 397

Bithorax комплекс (BX-C), 231

Blimp1, 372-374, 398-400

Bmi1, 223-225

Brahma, 49, 233, 243

BRG1, 235-236

BRM. См. Brahma Brown доминантный ( bwD ), 98

В-клетки, 388-392, 398-401

c-Kit рецептор (CD117) 390

C. elegans

— MES-модификаторы гистонов у, 296-298

— MSUD у, 296

— PcG-гены у, 215

— PRC2 и, 214-215

— RNAi и, 164

— X -хромосомная регуляция у 292, 294-298

— анатомия, 289

— веб-сайты с информацией о, 467

— гетерохроматиновые метки на единственной Х-хромосоме, 294-295

— детерминация пола у, 287-288 з

— ародышевых клеток спецификация у, 294, 373-374

— импринтинг Х-хромосомы сперматозоида у, 298-299

— компенсации дозы комплекс у, 288, 290-293

— неклеточно-автономный сайленсинг и транзитивность, у 184

— оценка отношения Х:А у, 290-291

— половых хромосом дисбаланс у, 288

— сайленсинг у, 283

— центромеры структура и функция у, 271

CAF. См. Фактора Сборки Хроматина комплекс

CARM 1, 201

Cd79a, клетки 391

CDKN1C, Беквита-Видеманна синдром и, 428, 430-431

Cdx2, 379

CenH-район. См. CENP-A

CENP-A

— RNAi и, 157

— общий обзор, 247-248

— поддержание, 114

— сайленсинг и, 115

— центромерный хроматин, 252-253, 272-275

— цетромеры дробянковых дрожжей и, 113-116

— эволюция центромеры и, 276-277

CHD белки, 197, 239 Chfr, 454

Chp1,109-110, 112, 114, 156,158-161

Chp2, 109-110

CHRAC, 309

Chromoshadow-домены, 93, 199, 305

Cidl2, 112, 114, 159-160

cis-модификаций паттерны

— H2AZ и, 258

— MSL комплекс и, 308

— болезни и, 426, 435-437

— геномный импринтинг и, 353-355, 363-364

— посттрансляционная модификация гистонов и, 204

CKcnplot1, 360

CLF. См. Курчавый лист

Clr4

— siRNA продукция и, 113

— гетерохроматина формирование, 110-114, 156-162

— рекрутирование энзимов, модифицирующих хроматин, 161-162

CMT3, 178

CpG динуклеотиды

— CpG-островки, раковые заболевания, 448-449, 451-452, 456-457

— МеСР2 и, 342-343, 432-433

— веб-сайты с информацией о, 465

— геномный импринтинг и, 362

— гиперметилирование, 449

— метилирование ДНК и, 51, 326, 334-338, 361,425

— модификации гистонов и, 455

— раковые заболевания и, 447

— у растений, 169

CPSF-A. См. Фактор-А специфичности расщепления-полиаденилирования

CREBBP, 432

CTCF, 340-341, 362-363

Cul4, 160

D. Melanogaster, спецификация зародышевых клеток у 373-374

D1, 101

d48, клеточная линия, 141-142, 147

DDM1. См. Сниженное метилирование ДНК 1

DDP1, 101

Demeter (DME), 174, 178, 181, 188, 378

Dicer

— MSUD и, 123

— RNAi-опосредованный сайленсинг у растений и, 182-187

— scnRNA модель и, 147

— siRNAsH, 112, 158-161

— модификации гетерохроматина и, 161-162

— подавление и, 121

— сперматогенез и, 377

Dicer-подобные (DCL) белки, 182-183

DIM-2, 120-123

DIM-5, 121-122

Dlk1 кластер, 357-359

DMRs, 357-359

Dnmts. См. Метилтрансферазы ДНК (DNMTs)

Docking-домены, 258

DOT1, 198,267, 297

DPY белки 290

dRingl (dRingl/SCE) белки, 219-220

DRM. См . Метилтрансферазы с перестроенными доменами Drosha, 185

Drosophila

— kismet (kis) и, 239-240

— MSUD отсутствие у, 283

— PcG гены у, 55, 216, 218, 220

— polyhomeotic ( ph ) дупликация у, 220

— PRC1 «нацеливание» у, 220-222

— RNAi и, 164

— веб-сайты с информацией о, 467

— гетерохроматину, 93, 100-101, 278-279

— дисфункция половой хромосомы у, 283

— как модельный организм, 36-37

— кариотип, 303 клеточная память и, 211

— компенсация дозы у, 288, 302-311

— метилирование и, 51

— модификации гистонов, сайленсинг и, 95-96

— мозаичные фенотипы у, 88-90

— «нацеливание» формирования гетерохроматина, 97-100

— неоцентромеры у, 272

— организация генома, 55

— процесс сегрегации у, 279

— сайленсинг и, 95-96, 101-102

— утрата отцовской хромосомы у, 281

— фактор нарушения сегрегации, 280-281

— хромосомные белки и модификаторы у, 90-93, 96-97, 268

— центромерный хроматин и, 274

dsRNA. См. Двухнитевая РНК

dsx гены, 306-307 DTip60, 259

E(var) (Enhancer of variegation), 90-92

E(Z) семейство. См. Энхансера zeste (E(Z)) семейство

E(Z)-ESC комплекс, 296-297. См. также PRC2

Е2А, 391-392

ЕЗ убиквитинлигаза, 429, 454

EBF1, 390-392

EMF. См. Эмбриональный Цветок (EMF)

ENCODE, 465

Enx1, 223, 325

ERC, 84

ESC. См. Сверхчисленные половые гребешки (ESC)

Eversporting displacements (Хромосомные перестройки, обусловливающие мозаичное проявление признака), 14, 27. См. также Мозаицизм, обусловленный эффектом положения

EZH2, 200, 224, 325, 388, 394

Ezh2/Enxl. 325

FACT. См. Облегчение транскрипции хроматина

Female-sterile homeotic (fsh) ген, 232

Flamenco , 164

Flt3, 390

FMRP белок, 436-437

FOX-1, 290

FR901, 228 460

Fragilis , 373

FWA. , 164

G9a, 400

GAGA фактор, 243

GASC1. См . jumonji-деметилаза гистонов (JHDM1)

Gnas семейство, 357-359, 428, 431

GNAT семейство, 194

Groucho семейство, 399-400

Gtl2 ,360

HI, 260, 472

H19 ген, 352-353, 360, 362-363, 428, 430-431

H2A

— дефектный по тельцу Бара (H2ABbd), 248, 259

— определение, 248

— откладка и замещение, 258-259

Н2АХ, 255-257, 267, 472

H2AZ 248, 257-259

— локализация, 250

— макро, 259, 323

— формирование вариантов, 248

Н2В 258-259, 469

H3, 196, 247-248, 251-254, 273-275, 469-471

H3.3, 248, 254-255, 275

H3.Зрепрограммирование сперматозоидов, 378

H3K27, метилирование

— MES белки и, 296-298

— PRC «нацеливание» и, 221

— V(D)J рекомбинация и, 394

— Х-инактивация и, 325-327

— гетерохроматиновый сайленсинг и, 95-96

— общий обзор, 200

— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 375

H3K36, 197-198, 297

H3K4, 196-197, 325-326

H3K79, 198, 267

H3K9

siRNAs и, 154 su(var) и, 95-96

— в единственных Х-хромосомах самцов C. elegans , 294-295

— метилирование ДНК и, 339-340

— «нацеливание» на гетерохроматин и, 87

— общий обзор, 198-200

— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 375

— распределение репрессированной ДНК, 138

— сайленсинг и, 95-96. 101-102, 109-111, 145-146

— сперматогенез и, 376

— у растений, 179