Чарльз Эллис - Эпигенетика

— центромерный хроматин и, 274

Н4

— KYP/SUVH4, 180

— MSL комплекс и, 304

— SIR комплексы и, 79-80

— общий обзор, 200

— таблица, включая ссылки, 471

— формирование вариантов и, 248

Нах гены развитие примордиальных зародышевых клеток и, 373

HBRM, 237

HDAC. См. Деацетилазы гистонов (HDACs)

HDOT1L, 198

her-1 ген, 291-293

HIC-1, 455

HIRA. См. Регулятор гистонов А

HKMTs. См. Метилтрансферазы лизинов гистонов (HKMTs)

HML, 74-75

HMR, 74-75

НО эндонуклеаза, 74-77

НОАР (HP1/ORC ассоциированный белок). 269

Homeless , 99-100 HOTHEAD ген, 21

Нох гены

— PcG белки и 212-213

— PcG сайленсинг и 219

— PREs и 220

— Sex combs reduced (Scr) и 234

— клеточная память и 211, 231

— регуляция у Drosophila 231-233

НР1. См. Белок гетерохроматина 1

HpaII крошечные фрагменты, 336-337, 340

НРone, 121

Hrr1, 112, 114, 159-160

hSET, 241

HU белки, 248

IAP ретротранспозон, 375, 377

ICE, 358-359, 361-363

ICF синдром. См. Иммунодефицитная Центромерная Нестабильность

IFNB1, 399

IGF2

— Беквита-Видеманна синдром и, 428, 430-431

— геномный импринтинг и, 352-353, 357-359, 362-363

— рак толстой кишки и, 453

IgH, 393

Ikaros-ассоциация, 398

IL-7, рецептор 390

In(l)wm4, 91. См. также white ген

INI1, раковые заболевания и, 235

INO80-C, 259

ISWI комплексы, 239, 309-310, 415. См. также Brahma семейство; SNF2H семейство

JIL1 киназа, 97-98, 102, 305

Jumonji-деметилаза гистонов (JHDM1), 47, 200

К79 метилирование, общий обзор, 198

KCNQ, 357-359, 430

killer штаммы, 133

Kismet (kis), 234-235, 239-240

KTO белок, 242

KYP/SUVH4 , 180

Light, 98

Like heterochromatin protein (LHP1), 182

Linaria vulgaris , 170

LSD1 аминоксидаза, 97

LSD1. См. Лизин-специфичная деметилаза

LSH2, 340

mb-1 ген, 392

MBD белки. См. Метил-CpG-связывающиеся белки

МеСР2, 342-343, 432-434

Medea (МЕА), 178, 180-181, 215, 217, 223-224

Medea/Fertilization independent seed formation (MEA/FIS1), 180

MEIDOS, 216

Meisetz, 376

MES белки, 215, 296-298

MIP. См . miRNAs, премейотически индуцированные метилированием

Miwi-подобные белки, 377

MIX-1 белки, 290

MLE, 304-306, 308

MLH1 ген, 437, 450, 453-454

MLL, 233, 235, 241

MNa3a. См. Микрококковая нуклеаза MOF, 304-306, 308

Morpheus-молекула (MOM), 181, 187

MS-275, 460

MSCI, 318

MSP, 459

MSUD. См. Мейотический сайленсинг неспаренной ДНК

mtF гены, 143-144

MYST семейство, 194

n -1 правило, 316, 319-320

Nanog, 375, 379-380

Nasonia vitripennis , 281

ncRNA-опосредованного сайленсинга модель, 362-364

Ndj1, 269

Necdin , 429

NESP55, 431

Neurospora crassa

— MSUD y, 117, 122-124, 282-283

— RIP и, 119 120, 123-124

— жизненный цикл, 116-117

— изображения, 118, 124

— как инструмент, 107

— как модельный организм, 36-37

— метилирование у, 117-119

— общий обзор, 116-117

— подавление у, 121-122

— сайленсинг у, 282-283

NONCODE веб-сайт, 360, 466

NotchL 391

Nowal, 146 NT-ES, 418-421

NuA4/Tip60, 259

NuRD, 343

NURF, 309, 429

NVP-LAQ824, 460

Oct4 , 379-380, 416

Oenothera blandina, 101

OSA, 239

P53BP1, 198

p55, 214

PADI4, 202, 378

PAF комплекс, 198

PAI2, 162

Paramecia, 36, 130-132. См. также Инфузории

Parp, 380

Pasha, 185

Pax5, 390-392, 396, 400-401

PcG белки. См. Polycomb белки

PGC-клетки, развитие примордиальных зародышевых клеток и, 372-375

Ph 1 локус, 280

PHERES 1, 216

Pickle (PKL), 181

Piwi, 100, 154-156, 160, 164

PML-лейкемия, 56

Pol IV. См. РНК-полимераза IV

Polar granule component (pgc) ген, 374

Polycomb (PcG) белки

— CpG метилирования и, 339-340

— HP1 и, 98

— Х-инактивация и 58, 325-326

— генетическая идентификация, 212-214

— геномный импринтинг и, 362

— клеточная память и, 56, 212, 230

— метилтрансферазы гистонов растений и, 180

— метки сайленсинга хроматина и, 214-219

— модификация хроматина у животных и, 164-165

— общий обзор, 54, 219

— поддержание транскрипционного сайленсинга и, 219-223

— развитие млекопитающих и, 223-226

— функция, 55-57 хроматин растений и, 180-181

— эпигенетическая регуляция у Arabidopsis и, 176

Polycomb репрессивные комплексы (PRCs)

— H3K27 метилирование и, 200

— Х-инактивация и, 57, 223

— клеточная память и, 211

— компоненты, 219-220

— компоненты и эволюционный консерватизм, 214-216

— модификация хроматина, 218

— «нацеливание» на сайленсированные гены, 220-222

— предотвращение наследуемой репрессии, 222-223

— репрессивные функции и, 222

— транскрипционная репрессия и, 231

— у растений, 180

— функция в развитии, 218-219

Polycomb элементы ответа

— GAGA фактор и, 243

— H3K27 метилирование и, 200

— антисайленсинг и, 223

— клеточная память и, 211

Polycomb-подобный (PCL) белок 215

— PRC1 «нацеливание» и, 220-222

— транскрипционная репрессия и, 232

PRC2. См. Пререпликационный комплекс 2

Prdm1, 398-399

Priming, линия, 391

PRMTs. См. Метилтрансферазы аргининов белков

PSR хромосома, 281-282

PTGS. См. Посттранскрипционный сайленсинг генов

Pws кластер, 357-359 RAG, 393, 420-421

RanGAP ген, 281

Rapl. См. Репрессор-активаторный белок I (Rapl)

RC гистоны, 250-251

RdDM. См. РНК-направляемое метилирование ДНК

rDNA, 84, 266, 278-279

rDNA кольца, 84

RDRP. См. РНК-зависимая РНК-полимераза

Replication processivity clamp (PCNA), 250

Rid ген, 120

Rikl, 160

Ring-белки, 213. 219-220, 242. 325

RIR См. Индуцируемая повторами точечная мутация

RISC. См. РНК-индуцируемый сайленсирующий комплекс

RITS. См. РНК-индуцируемый эффектор транскрипционного сайленсинга

RITS и сборка гетерохроматина и, 158-160

— сайленсинг и, 46

— сайленсинг у S. pombe и, 112, 115-116

— сайленсинг у инфузорий и, 139, 147

— сайленсинг у растений и, 182-187

— сборка «молчащего» хроматина и, 112

— сперматогенез и, 376

RNAi, 269. См. также Меиотический сайленсинг неспаренной ДНК (MSUD); Посттранскрипционный сайленсинг генов; Подавление

— Arabidopsis и, 162-164

— Chpl и, 109

— Drosophila и, 99

— dsRNA и siRNA и, 158-161

— НР1 локализация и, 121

— N. crassa и S. pombe и, 107

— ncRNAs и, 358-359

— PTGS у растений vs., 177

— геномные перестройки и, 139

— доказательства роли в сайленсинге, 156

— ломкой Х-хромосомы синдром и, 437

— метилирование ДНК млекопитающих и, 339-340

— модели распознавания и, 160-161

— модификация хроматина и, 113, 162-164

— общий обзор, 52-53, 153-154

— развитие многоклеточных и, 36

— рекрутирование хроматин-модифицирующих энзимов, 161-162

— сборка гетерохроматина и, 87-88, 102, 153-165

— структура хроматина и, 156-158

— у инфузорий, 130, 139, 147

Rolled, 93

roXRNAs, 48-49

Rsp, 281

RTT. См. Ретта синдрома

R-делеционные элементы, 143-144

Saccharomyces cerevisiae

— trans -взаимодействие у, 81-82

— trxG белки и, 236

— ацетилирование гистонов и, 80

— веб-сайты с информацией о, 466

— выпетливание теломер и, 80-81

— генетические инструменты, 72-73

— гетерохроматин, 74-78

— деацетилирование гистонов и, 78-79

— жизненный цикл, 73-74

— идентичность центромеры и, 275

— как модельный организм, 36-37

— наследование эпигенетических состояний у, 82-83

— нестабильность рДНК-повторов у, 84

— общий обзор, 71-72

— описание, 72-73

— организация генома, 54

— репрессия и, 79-80