Чарльз Эллис - Эпигенетика

Элементы контроля импринтов, 357-359

Элементы повторов, 81

Элонгация, PcG-сайленсинг и, 58

Эмбриогенез, 58, 322

Эмбриональные зародышевые клетки, плюрипотентные, 369

Эмбриональные стволовые клетки генерирование, 379-380

— использование в терапии, 418, 420

— метилирование de novo и, 335

— от ядерных пересадок (NT-ES), 418-421

— плюрипотентные, 369, 376, 379-382

— соматическое репрограммирование и, 58-59

— терапевтическое клонирование и, 418-421

Эмбриональный Цветок (EMF), 180, 216

Эмбрионы, 355-356, 406-407, 418

Эндонуклеазы, переключение типа спаривания и, 74-75

Энзимы, 18, 21, 29, 40, 46-48. См. также конкретные энзимы

Энхансеры

— zeste (E(Z)) семейство, 96, 179-180, 214, 224, 296-297

— аллельное исключение, 397

— мозаичности (E(var)), 90-92

— сайленсинг у C. elegans и, 296-297

Эпиаллели, 36, 177

Эпигенез, 369, 372

Эпигенетика, определение, 13, 27, 34, 38-39

Эпигенетическая память. См. Клеточная память

Эпигенетические импринты, определение, 298, 299

Эпигенетические методы терапии, для раковых заболеваний, 459-461

Эпигенетические состояния, определение, 38

Эпигенетический код, 38

Эпигенетический контроль, 62-64, 75-77

Эпигенетический ландшафт, развитие, 39

Эпигеномы, определение, 424

Эпимутации, болезни человека и, 437

Эписостояния, TSA-индуцированный сайленсинг и, 113

Эпифенотипы, 35

Эритроидные клетки, CMPs и, 390

Эссенциальный (Е) сайленсер, 77-78

Эстрогенный сигналинг, метилирование аргининов и, 201

Эухроматин

— H3K27 метилирование и, 200

— H3K4 метилирование и, 196-197

— H3K9 метилирование и, 198-200

— гетерохроматин vs., 44-46, 97, 100, 177

— «молчащий» хроматин и, 57

— определение, 34, 40, 71

Ядерная организация, общий обзор, 20-21

Ядерная эквивалентность, 405

Ядерный диморфизм, 36, 131, 135-136

Ядрышковое доминирование, 177

Яйцеклетки, 377, 407, 417-418

Яровизация (VRN), 180, 188, 214, 216-217

aИспользование строчных букв для обозначения модификаций помогает отличать их как от аминокислот (идентифицируемых по их однобуквенным кодовым обозначениям), так и от гистонов (таких, например, как Н2А), для которых всегда используются прописные буквы.

bНоменклатурное обозначение начинается (слева направо) с гистона, затем пишется остаток, затем — модификация. В тех случаях, где модифицированный остаток не известен или не важен, модификация должна следовать за гистоном, например: Н4ас и Н2Ваг1. Множественные модификации можно обозначать, просто расширяя список (например, H3K4me 3K9ac S10ph ...) по мере необходимости. Поскольку каждый отдельный модифицированный остаток начинается с прописной буквы, обозначающей аминокислоту, и поскольку сами модификации все обозначаются строчными буквами, нет необходимости в использовании запятых или точек, чтобы разделять отдельные модифицированные остатки в «слове», обозначающем комбинацию остатков; в этом случае остаток следует вставлять без добавлений (например, H3K9S10ph, чтобы указать H3, не модифицированный по Lys-9 и фосфорилированный по Ser-10).

cПолиубиквитилированные гистоны обозначаются ubn.

dВ настоящее время гипотетично.

С изменениями и с любезного разрешения из: Turner В.М., Nat. Struct. Mol. Biol. 12: 110-112. (2005).

Сокращение: (Hs) — Homo sapiens .

aЭпигенетическая особенность считается имеющейся на основе гомологии последовательностей, но не функциональных данных.

бИмеются данные, что метилирование H3K9 обнаруживается в районах активного хроматина; однако функциональное значение этого не известно.

вТриметилирование H4K20 у S. cerevisiae отсутствует, тогда как у многоклеточных организмов имеются все три состояния метилирования H4K20.

гУ Drosophila уровни метилирования ДНК очень низкие.

дМутантный Dnmt2.

еDnmt2 (Рр) и MBD-доменные белки (Се, Cb, Рр).

жDnmt2 и MBD-доменные белки (Dm).

зХромосомный или геномный, а не ген-специфичный.

Это предположение авторов, которое во время подготовки рукописи к печати, казалось довольно смелым, очень скоро стало реальностью. Клетки, обладающие всеми свойствами плюрипотентных стволовых клеток, были получены из дифференцированных клеток человека (Science, 2007,318: 1917–1920) и мыши (Cell, 2006, 126: 663–676). (Прим. перев .)