Чарльз Эллис - Эпигенетика

Транскрипционные факторы

— Rapl, 77-80

— SWI/SNF-комплексы как, 239-240

— trithorax (trxG) белки как, 243

— trxG белки как, 243

— варианты гистонов у инфузорий, 135

— интерференция метилирования ДНК с, 340-341

— лимфопоэз и, 389, 390-392

— модификации гистонов и, 192

— роль в эпигенетическом контроле. 390-392

Транскрипционный контроль, 257-258, 343

Транскрипционный сайленсинг генов (TGS). См. также ДНК и метилирование гистонов

— Alcohol dehydrogenase (Adh) трансгены и, 99

— PcG-комплексы и, 219-223 RNAi и, 112

— RNAi-опосредованный сайленсинг у растений и, 182-183

— Х-инактивация, 323-324

— гетерохроматин и, 52

— общий обзор, 153-154

Транскрипция

— Вс16 и Blimp 1 и, 398

— PRC1 и, 219

— SWI/SNF-комплексы и, 236-239

— trithorax (trxG) белки и, 242

— trxG белки и, 235-236

— аберрантная активация, 224-225

— ацетилирование и деацетилирование и, 193-195

— внутренний элиминируемый сегмент (IES) и, 53

— выравнивание генных продуктов и, 302, 305-306

— зависимая от метилирования репрессия, 343

— изменения в структуре хроматина и, 204-205

— изменения у с репрограммированием, 414-417

— метилирование ДНК и, 340

— механизм, 302

— модификации гистонов и, 40

— регуляция гистонами и ацетилированием, 193-195

— сайленсинг и, 52-53

— эухроматин и, 45

Транслокации, 327-328, 350-351, 447

Трансплантация ядер

— геномный импринтинг и, 352

— изменения, ассоциированные с, 414-417

— медицинские следствия, 418-421

— процедуры для, 406-409

— раковые заболевания и, 413-414

— соматическое репрограммирование и, 58-59

— фенотипы клонированных животных и, 409-414

— эпигенетическая память и, 417-418

Трансформирующая ДНК, 121 -122

Трихлоростатин A (TSA), 113, 115, 121, 325, 328-329

Трихогины, 116 тРНК, 109

Трофобласта защиты теория. 356

Трофэктодермы (ТЕ) слои, 371-372, 379-380

Т-хелперные клетки, 338, 343

Тэйтум и Бидл (Tatum, Beadle), 116

Убиквигин ЕЗ лигаза (UBE3A), 429, 454

Убиквитинирование

— Х-инактивация и, 324-325, 328

— общий обзор, 192, 202-203

— репарация ДНК, 267, 446

— сайты в гистоновых «хвостах», 41

Уилмса опухоли, 430. См. также Прадера-Вилли синдром

Упаковка, 248

Урацил-ДНК-гликозилазы, 343

Уремия, 438

Утрата гетерозиготности, 452

Утрата импринтинга (LOI), 60, 452

Утрата октамера, 204

Фактора Сборки Хроматина (CAF) комплекс, 83, 181, 250-251, 275, 378

Фактор-A специфичности расщепления-полиаденилирования (CPSF-A), 162

Факторы связывания, защита CpG-островков и, 339

Факультативный гетерохроматин, 40, 57-58, 323-325, 327

Фибробласты, 407, 411 Фолат, 435, 438

Фосфатазы (РРТазы), 42, 97

Фосфоинозитол 3-киназа-подобных киназ семейство, 255

Фосфорилирование, 40, 195-196, 255-257

Фотопериода путь, 216

Фотопериод-независимое раннее цветение (PIE), 181

Фрагментация. См. Фрагментация хромосом

Фрагментация хромосом, 138

Хиазматическая сегрегация, 278

Химеры, растения и, 172 «Храповик Меллера», 315

Хроматин. См. также «Молчащий» хроматин

— ICF синдром и, 434-435

— PcG и trxG и, 55-57

— Т-клеточные рецепторы (TCR) и 388

— trxG белки и, 236-242

— Х-инактивация и, 322-325

— Xist ген и, 322

— АТФ-зависимые комплексы ремоделинга и, 235

— болезни и, 426 в центромерах, 272-275

— веб-сайты с информацией о, 465

— влияние RNAi на структуру, 158-165

— влияние структуры на транскрипцию, 204-205

— ДНК vs., 40

— изменения при репрограммировании, 415

— история эпигенетики и, 14, 18, 34

— как матрица, 39-40

— клеточная память и, 63-65

— ломкой Х-хромосомы синдром и, 426, 436-437

— метилирование ДНК и, 339-340

— модификации гистонов, 49-50, 192

— молекулярные компоненты у растений, 177-182

— недостаточность по метилентетра-гидрофолатредуктазе и, 435

— общий обзор, 34, 38, 192 определение, 191

— организация, 39-44 плече-лопаточно-лицевая миопатия, 437

— раковые заболевания и, 447-448

— Ретта синдром и, 432-434

— Рубинштейна-Тайби синдром и, 432

— талассемии и, 435-436 функция, 34

— Шимке спондилоэпифизарная дисплазия и, 435

— эпимутации и, 437

— эухроматин vs. гетерохроматин и, 44-46

Хроматоидные тельца, 377

Хромодомены

— H2AZ и, 258

— H3K36 метилирование и, 197-198

— ORF «нацеливание» и, 195

— PcG и trxG и, 55, 218, 220

— компенсация дозы и, 304-305

Хромометилазы, 178

Хромосомных разрывов последовательности (CBS), 137-138

Хромосомы. См. также Сегрегация аномальная, 264

— изменения при репрограммировании, 415

— метилирование, 51

— метилирование ДНК, 343-344

— механизм наследования, 264-266

— «нацеливание» компенсации дозы», 307-309

— обзор организации, 35 организация, 314

— перестройки, 272

— полиплоидия и, 170

— политения, 35

— последовательности вздутий, 282

— разрывы хромосом и болезни, 434-435

— распределение trxG белков, 239

— родительская утрата, 281-282

— родительское происхождение и, 16

— стабильность, 344

— фрагментация у инфузории, 138-139

— эволюция Y-хромосомы, 315

— элементы, необходимые для наследования, 264-266

Цветение, яровизация и, 216-217

Центромерные внешние повторы, сайленсинг и, 111-112

Центромеры H3-варианты и, 252-254

— ахиазматическая сегрегация и, 278-280

— регуляция идентичности, 276

— состав у дробянковых дрожжей, 113-115

— структура, функция и воспроизведение. 275-276

— функция, 44

— хроматина состав в, 272-275

— хромосомная наследственность, 265

— эволюция, 276-277

— эукариотная структура и функция, 270-271

Цикл «разрыв-слияние-мостик», 268

Цитозин

— дезаминирование, 51, 388, 398

— метилирование и, 51, 177-178, 334-335

— раковые заболевания и, 448-449, 459

— Цитоплазматическая наследственность

— scnRNA модель и, 147

— менделевская наследственность vs., 133

— перестройки ресничек, 142-143

— серотипов, 133

— сканирования транскриптома модель и, 147-148

— следствия, 144

— у инфузорий, 132-133, 142-143

Цитоплазматические мостики. См. Плазмадесмы

Цитруллин, 202

Человеческие искусственные хромосомы (HACs), 271

Членистоногие, геномный импринтинг и, 350

Чужеродные последовательности, элиминация, 142-143

Шапероны, 83, 378

Шимке спондилоэпифизарная дисплазия и, 432, 435

«Шму» (Schmoos) [форма клеток у дрожжей], 73

«Шпилечная» РНК, 159

Эволюционно консервативные хромосомные сегменты (ECCS). 254. См. также Адаптивная эволюция

Экспрессия

— PcG-гена сверхэкспрессия и, 224

— ацетилтрансферазы гистонов (HATs) и, 29

— в В-клетках и плазматических клетках, 400-401

— геномный импринтинг и, 349-350

— импринтированных генов, 223-224

— клонирование и, 417

— контроль в лимфоцитах, 392

— локализация и, 20

— программы развития и, 377-379

— регуляция метилированием ДНК, 340-343

— регуляция Х-хромосом, 290

— эмбриональной эктодермы (Eed), 223

Экстраклеточный сигналинг, 390

Эксцизии. См. Внутренние

элиминируемые сегменты