Чарльз Эллис - Эпигенетика

Индуцированный вирусом сайленсинг генов (VIGS), 177, 183

Индуцированный повторами сайленсинг генов (RIGS), 101

Индуцируемая активацией дезаминаза (AID), 51, 388, 398

Инсулятора модель, 362-363

Инфузории

— RNAi у. 145, 147

— активный vs. «молчащий» хроматин у, 135-136

— жизненный цикл, 132

— зависимый от гомологии сайленсинг у, 139

— как модельный организм, 27, 36

— коньюгация и, 131-132

— общий обзор, 130

— патгернинг кортикальный у 133-134

— перестройки у, 138-139

— поддержание двух геномов, 131

— системы защиты генома у, 146-148

— цитоплазматическая наследственность у, 27, 132-133, 142-143

История эпигенетических исследований

— генетика и развитие и, 27

— геномный импринтинг и, 350-353

— гиперметилирование и, 449-450

— ДНК соматических клеток и, 28

— Колд Спринг Харбор и, 14-19

— метилирование и, 28, 448-450

— механистическая

— взаимосвязанность и, 30-31

— общий обзор, 26

— трансплантация ядер и, 406

— хроматин и, 28-30

Канцерогены, метилирование цитозина и, 449

Кариогамия, 107, 116-118, 120, 131-132

Кариотип Drosophila, 303

Киназы

— JIL1 киназа, 97-98, 102, 305

— модификации гистонов, 47

— фосфоинозитол 3-киназа-подобных киназ семейство, 255

Кинетохоры

— CenH3 и, 252-253

— CENP-Аи, 273-275

— идентичность центромер и, 275

— сайленсинг и, 108-111, 113-114

— формирование и функция, 271-272

— функция, 269

— хромосомная наследственность и, 264

— центромеры дробянковых дрожжей и, 108-109

Клетки крови, PcG-репрессия и, 223

Клеточная память

— Нох-гены и, 211, 231

— PcG и trxG и, 55-57

— метилирование ДНК и, 334-335, 343

— общий обзор, 211-212, 230-232

— повторяющиеся элементы и, 54

— трансплантация ядер и, 417-418

Клеточные судьбы. См. Соматическое репрограммирование

Клеточный цикл, 49, 82, 221, 412

Клонирование. См. Трансплантация ядер; Репродуктивное клонирование

Клоны, 35, 409, 414 417

Кнудсона (Knudson) двухударная теория, 60

Ковалентная модификация. 34, 241-242, 244

Когезины, 83, 114-115, 165, 256-257

Коллохоры, 278-279

Кольца повторов экстрахромосомной рДНК (ERC), 84

Коммитирование линий, 390-392

Компактизация, эволюция гистонов и, 259-260

Компартментализация у инфузорий. 130

Компенсация, 419. См. также

Компенсация дозы

Компенсация дозы

— клонирование и, 417

— механизмы 58

— определение 287

— у C. elegans 288, 290-293

— у Drosophila 302-311

— у млекопитающих 288, 313-330

Комплекс компенсации дозы (DCC), 288, 290-293

Конденсация, 33, 76-77, 294, 298-300

Конденсины, их сходство с DCC, 288, 290

Конститутивный гетерохроматин, 40, 44, 57-58, 323-325

Контролирующие элементы, 14

Контрольная Точка Сборки Веретена (SAC), 269

Коньюгация, 131-132

Координация, ремоделин хроматина и, 49

Корепрессоры, 342

Короткие интерферирующие РНК (siRNA), 52, 112-114, 139

Кортикальный паттернинг, 133-134

Косупрессия, 121, 177. Си. также Посттранскриппионный сайленсинг генов

Кошки, клонирование, 35

Крючки аскогенных гиф,

Кукуруза, 280, 282

Курчавый лист (CLF), 180, 213, 215-216

Кэпирование, 80

Лейкемия, 56, 235, 413, 447-448, 459

Лизин-специфичная деметилаза (LSD1), 47, 180, 200

Лизины. См. также Метилтрансферазы лизинов гистонов (HKMTs)

— ацетилирование, 194

— деметилирование, 200

— метилирование, 47, 180, 200

Лимфомагенез, 223

Лимфоциты

— ICF синдром и, 434

— В-клеток дифференцировка и, 398-401

— клонирование мышей из, 412-413

— коммитирование линий в, 390-392

— плюрипотентность и, 390

— разнообразие рецепторов антигенов и, 392-398

Линкерные гистоны, 251, 260, 376

Локализация, экспрессия генов и, 20

Ломкой Х-хромосомы синдром, 426, 436-437

МакКлинток (McClintock), Барбара, 268

МакроН2А, 259, 323, 472

Макронуклеусы

— активный vs. «молчащий» хроматин и, 135-135

— деление у инфузорий, 140-144

— индукция специфических делеций у инфузорий, 140-141

— определение, 130

— перестройки у инфузорий и, 131

— «спасение» наследуемых делеций в, 142-143

— фрагментация хромосом и, 138

М-делеционные элементы, 143-144

Медицина, трансплантация ядер и, 413-414

Межгенные повторы. См. Неточные делеции

Мейоз

— гетерохроматин и, 280-282

— зародышевых клеток эпигенетические механизмы и, 376

— процесс, 264-265, 288, 290

— хромосомная наследственность и, 264-265

Мейотический дрейф, 277-278, 280-282

Мейотический сайленсинг неспаренной ДНК (MSUD)

— RNAi и, 156

— у C. elegans, 296

— у Drosophila, 283

у Neurospora crassa, 117, 122-124, 282-283

— у мышей, 283

Меллер (Muller, H.J.), 303

Менделевская наследственность, 34-35, 133, 187

Метил-CpG-связывающиеся белки

— 5-метилцитозин, 448-449

— метилирование и, 51, 178-179, 341 -342

— репарация ДНК и, 343

— репликация ДНК и, 341-342

— Ретта синдром и, 342-343, 432-434

— сводка функций, 342

— транскрипционный контроль и, 343

— функция, 334

Метилентетрагидрофолат редуктазы недостаточность, 435

Метилирование. См. также

Метилирование ДНК

— — В-клеток развитие и, 392-395

— MSUD и, 122-123

— PRC2 и, 218

— RIP и, 119-120

— trxG белки и, 242

— Х-инактивация и, 318, 325

— аномальное у клонированных эмбрионов, 416

— аргининов, 47, 201-202

— болезни и, 435

— в трофоэктодермальных клетках, 380

— гетерохроматиновый сайленсинг у Drosophila и, 95-96

— гипотеза гистонового кода и, 19

— исторические симпозиумы, 15-17

— история эпигенетики и, 28

— кластеры импринтированных генов и, 359-360

— контроль у Neurospora, 120-121

— модификации гетерохроматина, 163

— модификации гистонов и, 40, 47, 135

— «молчащий» хроматин и, 254

— наследуемость, 334

— неопластическая трансформация и, 60-61

— общий обзор, 50-51, 196-202

— определение, 34

— отсутствие у S. pombe и, 108

— поддержание, 118, 120, 178, 335, 361

— распределение репрессированной ДНК и, 138

— регуляторы у растений, 53, 177-178

— репарация ДНК и, 267

— репликация ДНК и, 30

— сайленсинг растений и, 53

— сайты в гистоновых «хвостах», 41

— транскрипционный контроль и, 236

— у Neurospora crassa, 117-119

— функция, 34

— эпигенетическая регуляция у Arabidopsis к, 174

Метилирование denovo, 177-178, 186-187, 335-337

Метилирование ДНК

— CpG-островки и, 455-456

— N. crassa и, 107

— siRNAs и, 154

— Х-инактивация и, 325

— аллельное исключение, 396-398

— болезни и, 424-426, 430-431

— в ICM клетках, 379

— в эмбриональных стволовых клетках, 380

— веб-сайты с информацией о, 465

— внешняя среда и, 345, 438-439

— геномный импринтинг и, 354, 360-362

— ингибиторы, 459-460

— картирование, 338

— клеточная память и, 334-335

— мутации и, 343-344

— происхождение паттернов, 335-340

— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 375

— раковые заболевания и, 446, 448-449, 452, 459

— регуляция экспрессии генов, 340-343

— репрограммирование и, 378-379

— у млекопитающих, 334

— у растений, 170

— хромосомная стабильность и, 344

Метилирование, индуцированное премейотически (MIP) 120, 156