Карин Мёллинг - Вирусы: Скорее друзья, чем враги

Общество научных исследований им. Макса Планка – сеть научно-исследовательских организаций, включает около 100 различных институтов, находящихся главным образом в Германии.

Одиночные LTR – гомологическая рекомбинация приводит к уничтожению участков, находящихся между двумя LTR, и остается один; способны активировать соседние гены. В геноме человека примерно 400 000 таких последовательностей.

Онкоген – раковый или опухолевый ген ретровирусов, в частности src, raf, ras, myc, около 100 известных модифицированных клеточных протоонкогенов, которые часто являются стимулирующими рост генами или регуляторами генов (транскрипционные факторы); РНК-онкогены – микроРНК (miR), а также T-антиген SV40, ДНК-содержащий вирус.

Опухолевый или T-антиген – онкоген в малых ДНК-содержащих вирусах, в частности вирусе обезьян 40 (SV40) или полиомавирусе (Py); обычно не связан с раком у человека, но используется в качестве модели рака в лабораторных условиях, где вызывает рак при интеграции вируса.

Основание или пара оснований (сокращенно bp или по) – термин обозначает двухцепочечные нуклеотидные кислоты или только одно основание, состоящее из собственно основания и сахара, которые являются строительными блоками одноцепочечной ДНК или РНК. Пара оснований наблюдается в двухцепочечных ДНК и РНК, которые обозначаются А–Т и G–C для ДНК или A–U и G–C для РНК.

ОТ – обратная транскриптаза.

Парамутация – наследование генетической информации без мутаций, не подчиняющееся законам Менделя, в силу чего называется «парамутация», впервые описана Ройялом Александром Бринком, является предметом новых исследований. Трансгенерационные или парагенетические эффекты отличаются от эпигенетических в силу того, что эти мутации дольше сохраняются, наследуются и обусловлены изменениями в упаковке хроматина. Сформировавшиеся у C. elegansособенности сохранялись в течение 30 поколений. Парамутации существуют у растений, отмечаются у мышей; не известно, есть ли они у человека; соответствуют теории Ламарка (теории наследования приобретенных признаков).

Параретровирус – ДНК-содержащий вирус, использующий для репликации обратную транскриптазу, например вирус гепатита В (HBV), растительный вирус мозаики цветной капусты или «пенистые» вирусы, образует крупную прегеномную РНК внутри клеток.

«Пенистые» вирусы – параретровирусы, у которых жизненный цикл несколько отличается от жизненного цикла ретровирусов. Осуществляют обратную транскрипцию от вирусной РНК к провирусной ДНК перед тем, как вирус покинет клетку, а не перед внедрением в нее. Таким образом, сгруппированный вирусный геном представляет собой ДНК, а не РНК, как у ретровирусов. Другими параретровирусами являются вирус гепатита B (HBV) или вирусы растений, например вирус мозаики цветной капусты. Они упаковывают ДНК в вирусные частицы и поэтому на первый взгляд не похожи на ретровирусы.

Пептид – короткий белок.

Первичный бульон – термин, введенный Чарлзом Дарвином для описания условий внешней среды [24] Ч. Дарвин не использовал термин «первичный бульон», но саму идею выразил в термине «маленький теплый пруд». Термин «первичный бульон» в 1924 г. ввел советский ученый А.И. Опарин, но так как его работы были известны только в СССР, то в 1929 г. английский ученый Дж. Холдейн самостоятельно ввел этот же термин (primordial soup). – Прим. ред. , существовавших на первых этапах формирования жизни на Земле, в которых возникли первые биомолекулы и жизнь. По определению Джона Сазерленда, в его состав могут входить цианид водорода, сульфид водорода, фосфат и вода – все они под воздействием источника энергии, в частности ультрафиолета, могут обусловить формирование строительных блоков жизни, таких как аминокислоты, нуклеиновые кислоты и липиды.

ПКП (PEP) – постконтактная профилактика, которая предусматривает проведение антиретровирусной терапии в течение от четырех до 24 или 72 часов в зависимости от препарата для предотвращения ВИЧ-инфекции, несмотря на наличие половых контактов («утро после таблетки»).

Плазмиды – «голые» (неассоциированные белки, см. хроматин) кольцевые двухцепочечные ДНК внутри клеток (главным образом бактерий), могут переносить гены из одной клетки в другую; одним из таких примеров является Ti-плазмида Agrobacterium tumefaciens, которая индуцирует развитие опухоли у растений и лежит в основе генной терапии растений; вакцины на основе ДНК плазмиды кодируют белки/антитела, продуцируемые реципиентом после инъекции.

Плацента – слой клеток, отделяющий иммунную систему матери от эмбриона; см. синцитин.

Поли-ДНК-вирус – вирус насекомых, несущий 30 ДНК-плазмид из ДНК хозяина, кодирующий токсины и другие белки; имеет симбиотические отношения с осами; вирусные частицы не содержат вирусный геном, который вместо этого интегрируется в геномы ос; вирус передается вместе с яйцами насекомых, которые откладываются в живых гусеницах, что помогает прокормить личинок ос, уничтожая гусениц и используя их в качестве пищи, для чего задействуются транспортируемые гены токсинов, что напоминает механизм вирусных векторов при генной терапии.

Полимераза – фермент, необходимый для синтеза (полимеризации) биополимеров, в частности, нуклеиновых кислот, которые нужны для репликации ДНК или РНК в клетках и вирусах; обратная транскриптаза определяется как РНК-зависимая ДНК-полимераза.

Полимеразная цепная реакция – см. ПЦР.

Пребиотик – см. пробиотик.

Прион – понятие, состоящее из двух слов, а именно «белок» ( protein) и «инфекция» ( infection), обозначающее белковый инфекционный агент, состоящий «только из белка» и не имеющий нуклеиновых кислот. Прионовые белки, которые естественным образом присутствуют в тканях головного мозга, под действием средовых или генетических факторов или инфекции могут стать «неправильно свернутыми» наряду с другими неправильно свернутыми прионами; неправильное сворачивание ( misfolding) приводит к агрегации прионов и развитию нейродегенеративных заболеваний. Здоровые прионные белки, называемые PrP, имеют структуры, отличные от тех, у которых сворачивание вызывает развитие заболеваний (PrPSc возникает из-за болезни скепи у овец, вызываемой неправильно свернутыми прионами); у них больше складчатых бета-слоев и меньше альфа-изгибов. В 1997 г. первооткрыватель прионов Стенли Прузинер стал лауреатом Нобелевской премии. Инфицирование человека прионами может происходить при потреблении мяса. Прион является возбудителем губчатой энцефалопатии крупного рогатого скота (ГЭКРС) (коровье бешенство), или куру (заболевание, ранее наблюдавшееся в племенах каннибалов в Папуа – Новой Гвинее), или скепи у овец; обобщенное название этих инфекционных заболеваний – ТГЭ (трансмиссивная губчатая энцефалопатия).