Знание-сила, 2006 № 08 (950)

Такие модели позволяют делать нетривиальные предсказания. Так, при сравнении с экспериментальными данными было замечено, что, хотя интенсивности реакций в клетках дикого типа, у которых "ничего не испорчено", предсказываются хорошо, предсказанные интенсивности в мутантах далеки от измеренных. То есть бактерия дикого типа действительно растет самым быстрым возможным для себя способом, а мутант — нет. Оказалось, что мутант растет не вообще самым быстрым способом, а самым быстрым из возможных при небольшом отклонении от параметров, характерных для дикого типа. В данном случае следует искать не глобальный оптимум, а ближайший к оптимуму для дикого типа локальный

С другой стороны, через несколько сотен поколений экспериментально измеренные интенсивности реакций в мутантах приближаются к тем, которые были предсказаны первоначальной процедурой поиска глобального оптимума. Похоже, что в начале эксперимента регуляторные механизмы позволяют лишь небольшую подстройку, и интенсивности реакций в мутанте недалеко отклоняются от оптимума дикого типа. Однако после достаточно продолжительного культивирования регуляция экспрессии генов позволяет мутанту найти глобальный оптимум, отвечающий новой конфигурации метаболической сети.

До сих пор мы говорили о биоинформатическом анализе бактериальных геномов. Действительно, это та область, в которой предсказание генотипа по фенотипу уже стало реальностью. Однако и молекулярная биология многоклеточных организмов коренным образом изменилась с появлением геномов и других видов массовых данных. Компьютерный анализ дает возможность выделять ограниченный набор генов-кандидатов на выполнение той или иной функции и затем уже ставить целенаправленные эксперименты с конкретными белками, кодируемыми этими генами.

Наиболее ярким и неожиданным примером такого подхода, пожалуй, является поток работ по анализу региляторных микро-РНК. Эти короткие молекулы РНК длиной 20—25 нуклеотидов были обнаружены экспериментально и сначала считались экзотической системой, влияющей на экспрессию лишь нескольких генов. Однако за последние два года стало ясно, что сотни различных микро-РНК регулируют экспрессию тысяч генов человека, и. тем самым, оказалось, что в клетках животных и растений существует неизвестный ранее фундаментальный механизм регуляции генной активности. При этом обнаружить множество новых микро-РНК позволил именно компьютерный анализ, а сравнительный анализ геномных последовательностей человека, мыши и других животных предсказал регулируемые этими микро-PH К гены. Часть соответствующих предсказаний уже подтверждена экспериментально. Эти работы — пожалуй, первый пример того, как целое направление в молекулярной биологии с самого начала строится с учетом и в зависимости от компьютерного анализа геномных последовательностей .

Мы рассмотрели только одно направление современной биоинформатики. За рамками этой заметки остались, в частности, проблемы молекулярной эволюции — области, в которой компьютерный анализ является основным, если не единственным исследовательским инструментом. Подхода и примеры, описанные здесь, — та часть биоинформатики, которая ближе всего к экспериментальной биологии. В этой области, впрочем, как и в других, весьма сильны позиции российской биоинформатической школы, оказавшей решающее влияние на формирование целых направлений в распознавании генов и регуляторных сигналов, функциональной аннотации генов, сравнительной и эволюционной геномике.

Продолжаем публиковать рубрику "Что мы знаем о Лисе" интернет-издания "Демоскоп".

В отличие от В.Глазычева, который вовсе не министр, а социолог и автор одной из статей этого номера, министры, судя по этой публикации, весьма смутно представляют себе, чем и кем именно они управляют...

Министр регионального развития РФ Владимир Яковлев ЗНАет, что: "Население России сократилось в 2004 году на 1 миллион 700 тысяч человек". Об этом он сообщил на заседании рабочей группы совета по конкурентоспособности и предпринимательству "Демография и трудовые ресурсы" ("Сельская жизнь" 26 апреля 2005 года). А затем знания министра даже окрепли, и в интервью "Известиям" он сказал, что вообще "в последнее время население страны уменьшается быстрыми темпами — до 1,5 млн. в год"

("Известия". 18 мая 2005 года).

Демоскоп знает больше. Нам кажется, что министр избрал правильную информационную стратегию. В конце концов, кто-то же должен наконец по-настоящему напугать это пассивное, не понимающее правительственных видов и своей неконкурентоспособности население. Пусть оно, черт возьми, почувствует опасность! А опасное должно быть величаво.

Конечно, на самом деле население сокращается не так быстро. Например, в 2004 году оно сократилось не на 1,7, а всего лишь на 0,7 миллиона человек. Тоже, разумеется, немало, но не для человека с таким размахом, как Владимир Яковлев. Разумеется, можно было бы сказать, что вот уже шесть лет, как население России сокращается на 600—700 тысяч человек в год, а с 1992 года уменьшилось уже, почитай, на 7 миллионов человек, и это было бы правдой. Но чем же тогда министр будет отличаться от любого другого человека, который давно это знает? А тем более, от любого другого министра? Нет, тут нужен масштаб.

Недостаточно напуганный народ может не понять, что хорошо осведомленные министры — это его единственное спасение, поэтому лучшим министрам приходится все время себя просвещать, а потом приобщать к своей просвещенности всех остальных.

На очередном сеансе такого приобщения министр Яковлев сообщил нам, что "сегодня у нас 145 миллионов человек населения, а работоспособных — порядка 50 миллионов человек... Среди этой 50-миллионной группы людей — 30 миллионов женщин, из них одна треть — безработные".

Мы не знаем, кого считает работоспособными министр, но если использовать принятые в российской практике критерии, то, по недавней переписи, население трудоспособного возраста (мужчины от 16 до 60 и женщины — от 16 до 55 лет) составляло в России 89 миллионов человек, из них 44 миллиона имели женский пол. А давеча Демоскоп, фланируя, по своему обыкновению, по Интернету, невзначай набрел на сайт Росстата и обнаружил, что в 2003 году, например, число занятых в экономике Российской Федерации составляло 66 миллионов человек, и женщин среди них было более 32 миллионов. А безработных женщин было 2,6 миллиона.

У министра какие-то иные сведения, и другой бы сказал, что министр заблуждается, что он что-то перепутал (страну, например, или что-нибудь еще). Но не таков Демоскоп. Он понимает, что именно эту страну министр и берет на испуг — дабы она ценила его пропорционально опасности, от которой он вот-вот ее оградит. И поэтому он совершенно правильно делает, что не останавливается на чем- то одном, хотя и неверном, но пугающем. Он использует методику таких больших порций лапши, какие только способна принять развесившая уши пресса.