Ирина Якутенко - Вирус, который сломал планету. Почему SARS-CoV-2 такой особенный и что нам с ним делать

Рекомбинация. Обмен фрагментами генома. Может происходить как между отдельными хромосомами внутри одного организма, так и между геномами различных организмов и вирусов. Рекомбинация крайне важна для генерации генетического многообразия.

Репликация. То же, что размножение.

Респираторный (вирус). Вирус, поражающий дыхательные пути.

Рибосома. Молекулярная машина, синтезирующая белки на основе информации, записанной в мРНК.

РНК. Сокращение от «дезоксирибонуклеиновая кислота». Как и ДНК, образует длинные полимерные молекулы, составленные из четырех блоков — нуклеотидов. Нуклеотиды РНК и ДНК разные, кроме того, в отличие от ДНК, РНК не формирует двойную спираль. В РНК закодирована наследственная информация многих вирусов.

Серологический тест. В данном случае тест на антитела к коронавирусу. Название происходит от английского слова serum , то есть сыворотка крови.

Спайк-белок. Один из поверхностных белков коронавируса, при помощи которого он цепляется за клеточные рецепторы ACE2. Именно на спайк-белок направлено основное внимание ученых, разрабатывающих лекарства и вакцины против COVID-19. Если им удастся каким-то образом вывести спайк-белок из игры, вирус не сможет заражать новые клетки.

Стероиды. Органические вещества с определенной структурой (которая включает четыре кольцевых углеводородных кольца с «довеском»). В живых организмах выполняют два типа функций: входят в состав клеточных мембран и являются важными сигнальными молекулами. К стероидам относятся глюкокортикоиды, стероидные гормоны, продуцируемые корой надпочечников, и их синтетические аналоги. Они обладают широким спектром действия, в том числе угнетают иммунитет и снижают воспаление.

Субъединичная вакцина. Вакцина, представляющая собой белок возбудителя того или иного заболевания или его фрагмент.

Суперраспространение. Эпидемиологический феномен, когда инфицированный заражает намного больше других людей, чем большинство других инфицированных. Иногда используется синоним «суперспрединг», калька с английского superspreading , то есть суперраспространение.

Фомит. Предмет или поверхность, загрязненные инфекционными агентами.

Фурин. Протеаза, присутствующая на внешней поверхности многих человеческих клеток. Коронавирус использует эту протеазу для проникновения внутрь клеток: она расщепляет спайк-белок, после чего вирусная частица как бы подтягивается ближе к клеточной мембране.

Цитокиновый шторм. Патологическая гиперактивация иммунной системы, в ходе которой иммунный ответ раскручивается все сильнее и сильнее, вместо того чтобы постепенно угасать. Выделяемые иммунными клетками цитокины, стимулирующие воспаление, привлекают новые иммунные клетки, которые, в свою очередь, тоже выделяют цитокины.

Цитокины. Общее название небольших белков, выделяемых клетками и выполняющих сигнальную функцию.

Цитоплазма. Внутреннее пространство клетки за исключением ядра.

Экспонента. Функция вида y = e x, где e — математическая константа, примерно равная 2,72 (число Эйлера). Параметры процессов, протекающих экспоненциально, за одинаковое количество времени меняются в одно и то же количество раз.

Эндоплазматический ретикулум.Особое пространство внутри клетки, лабиринт из мембранных стенок. Внутри эндоплазматического ретикулума, в частности, синтезируются белки и липиды.

Эндосома. Мембранный пузырек, чаще всего формирующийся при «впячивании» той или иной клеточной мембраны. Например, когда иммунные клетки проглатывают вирус, они заключают его как раз в такой пузырек.

Эпитоп. Небольшой фрагмент чужеродной молекулы, к которому прикрепляются рожки антител. На одной и той же молекуле может быть множество различных эпитопов, каждый из которых узнается своим отдельным антителом.

Ядро. Ограниченное двойной липидной мембраной пространство, внутри которого находятся хромосомы. Организмы, клетки которых имеют ядро, называют эукариотами — в противовес прокариотам, у которых ядра нет, а геном находится непосредственно в цитоплазме, хотя может быть прикреплен к тем или иным структурам. К прокариотам относятся, например, бактерии.

ACE2. Рецептор на различных клетках человека, цепляясь за который коронавирус проникает внутрь клетки.

B-клетки. Особый тип лимфоцитов (клеток иммунной системы), отвечающий за синтез антител. Часть системы адаптивного (приобретенного) иммунитета.

BSL-3. Лаборатория повышенного класса защиты, в данном случае третьего. В таких лабораториях ученые работают с опасными патогенами. Всего различают четыре класса защиты лабораторий. В лабораториях класса BSL-1 работают с безобидными объектами. Самый серьезный класс защиты — BSL-4. В таких лабораториях исследуют наиболее опасные микроорганизмы и вирусы, например возбудителей сибирской язвы, чумы, лихорадки Эбола.

CD147. Рецептор на различных человеческих клетках. Предположительно, коронавирус может использовать его, чтобы проникать внутрь клеток.

MERS. Ближневосточный респираторный синдром (название — сокращение от англ. Middle East respiratory syndrome ). Самый злобный из группы коронавирусов, с летальностью около 35 %. Самые крупные вспышки происходили в 2012 году в Южной Корее и в 2015 году в Саудовской Аравии. Отдельные случаи заболевания регистрируются до сих пор.

RBD-участок. Участок спайк-белка коронавируса, непосредственно связывающийся с рецептором ACE2 на человеческих клетках (название — от англ. receptor binding domain ).

SARS. Вирус атипичной пневмонии (название — сокращение от англ. severe acute respiratory syndrome , тяжелый острый респираторный синдром). Также относится к группе коронавирусов, но отличается довольно высокой летальностью — около 11 %. Вспышки SARS детектировались в разных странах мира в 2002–2004 годах.

T-клетки. Особый тип лимфоцитов (клеток иммунной системы), узнающий и уничтожающий патогены (Т-киллеры). Еще одна разновидность Т лимфоцитов — Т-хелперы — помогает B-клеткам более эффективно синтезировать антитела. Относятся к системе адаптивного (приобретенного) иммунитета.

TMPRSS2. Протеаза, присутствующая на внешней поверхности многих человеческих клеток. Коронавирус использует эту протеазу для проникновения внутрь клеток: она расщепляет спайк-белок, после чего вирусная частица как бы подтягивается ближе к клеточной мембране.

Решение написать книгу о коронавирусе было принято спонтанно — как и большинство других решений в эту эпидемию — поэтому никаких условий для такой работы не было. У меня только что родилась вторая дочь, а первая маялась от скуки дома на карантине. Кафе, рестораны и коворкинги, где можно сосредоточиться хотя бы на несколько часов, закрыты, и выйти из дома можно только на прогулку в парк. Значительная часть книги написана именно там, на лавочке возле пруда, пока младенец спал в коляске, так что первая моя благодарность — властям Германии, которые смогли не довести ситуацию до предела, после которого нужно было бы вводить полный локдаун.